125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2001 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2001  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
188 aa  374  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  89.36 
 
 
188 aa  336  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  88.83 
 
 
188 aa  333  9e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  63.39 
 
 
188 aa  236  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1810  hypothetical protein  62.23 
 
 
187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00248062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  61.83 
 
 
188 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  59.02 
 
 
186 aa  223  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2041  hypothetical protein  56.38 
 
 
186 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5199  hypothetical protein  41.1 
 
 
234 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  38.55 
 
 
196 aa  104  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  37.02 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  38.12 
 
 
201 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  31.18 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3807  protein of unknown function DUF820  32.8 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1588  hypothetical protein  35.37 
 
 
194 aa  90.9  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.856601  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  32.78 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1860  hypothetical protein  35.59 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.571985  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  33.15 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  32.8 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  33.9 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  30.99 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  33.52 
 
 
191 aa  87  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  31.91 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  33.51 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3925  hypothetical protein  35.39 
 
 
188 aa  84.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.948868 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3717  hypothetical protein  32.8 
 
 
197 aa  84.3  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.0468458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2565  protein of unknown function DUF820  32.93 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2885  hypothetical protein  32.12 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142642  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  36 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0961  protein of unknown function DUF820  38.69 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0036  hypothetical protein  32.6 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000477397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2361  hypothetical protein  32.24 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  32.73 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  32.73 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  33.75 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0988  protein of unknown function DUF820  36.5 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4826  hypothetical protein  32.12 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0786797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4343  protein of unknown function DUF820  32.67 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4405  protein of unknown function DUF820  32.67 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738575  hitchhiker  0.000905365 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5334  protein of unknown function DUF820  35.97 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.510489  normal  0.17641 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0248  protein of unknown function DUF820  32.6 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  27.6 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4289  hypothetical protein  34.22 
 
 
211 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5107  protein of unknown function DUF820  33.71 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.604393  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4644  hypothetical protein  33.71 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  34.22 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0173  protein of unknown function DUF820  30.82 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  29.21 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0390  protein of unknown function DUF820  29.94 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  32.68 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1727  protein of unknown function DUF820  35.06 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2628  protein of unknown function DUF820  29.52 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3475  protein of unknown function DUF820  29.52 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4337  protein of unknown function DUF820  25.84 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1751  protein of unknown function DUF820  33.77 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  30.32 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3386  protein of unknown function DUF820  26.79 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127932  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5185  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2266  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0466597  hitchhiker  0.000108655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1626  protein of unknown function DUF820  27.54 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1601  protein of unknown function DUF820  27.54 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  32.37 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2432  hypothetical protein  28.57 
 
 
202 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal  0.365453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3808  protein of unknown function DUF820  30.73 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0741  protein of unknown function DUF820  28.16 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  30.9 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3531  hypothetical protein  30.77 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151198  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4909  protein of unknown function DUF820  36.78 
 
 
192 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2551  protein of unknown function DUF820  28.72 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2886  hypothetical protein  31.48 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1442  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  31.71 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  32.19 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0614  hypothetical protein  31.45 
 
 
207 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  37.41 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3395  protein of unknown function DUF820  26.9 
 
 
191 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2718  protein of unknown function DUF820  26.9 
 
 
191 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.602399  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  32.77 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  29.22 
 
 
193 aa  57.8  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1286  protein of unknown function DUF820  26.7 
 
 
193 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  32.26 
 
 
244 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  32.89 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1255  protein of unknown function DUF820  26.7 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2595  hypothetical protein  24.86 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0392428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  35.16 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  29.22 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5140  protein of unknown function DUF820  28.32 
 
 
200 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2541  protein of unknown function DUF820  28.48 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  31.14 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  31.5 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  32.37 
 
 
184 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2079  hypothetical protein  24.21 
 
 
218 aa  55.1  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204058  hitchhiker  0.000474177 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3054  protein of unknown function DUF820  31.64 
 
 
189 aa  54.7  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0573  protein of unknown function DUF820  26.47 
 
 
196 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4308  protein of unknown function DUF820  29.14 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1422  hypothetical protein  34.21 
 
 
129 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0659527  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3157  protein of unknown function DUF820  25.75 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4290  protein of unknown function DUF820  23.87 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3545  protein of unknown function DUF820  27.91 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>