More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1961 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  95.16 
 
 		 724 aa  1341    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  65.71 
 
 		 755 aa  912    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  68.38 
 
 		 719 aa  975    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  92.61 
 
 		 724 aa  1302    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 705 aa  1424    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  54.81 
 
 		 771 aa  742    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  65.22 
 
 		 756 aa  915    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  45.91 
 
 		 727 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  44.38 
 
 		 755 aa  534  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  40.34 
 
 		 707 aa  463  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  41.58 
 
 		 735 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 693 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 709 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 757 aa  353  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  35.05 
 
 		 707 aa  336  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 		 770 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 		 710 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 719 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 		 710 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  35.35 
 
 		 706 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  35.35 
 
 		 706 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 		 792 aa  324  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  35.46 
 
 		 695 aa  318  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 694 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 715 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 700 aa  270  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 689 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 689 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 821 aa  259  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  29.44 
 
 		 753 aa  254  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 747 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 745 aa  251  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 698 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 732 aa  249  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 726 aa  248  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 766 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 726 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  30.03 
 
 		 772 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 748 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 747 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 747 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 748 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  30.56 
 
 		 748 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 747 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  30.91 
 
 		 743 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  29.84 
 
 		 680 aa  241  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 732 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 712 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 748 aa  238  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 656 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 749 aa  238  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 740 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 747 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 747 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  29.16 
 
 		 747 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 742 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 742 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 708 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 753 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 732 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 759 aa  230  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 769 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 777 aa  229  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 850 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  30.01 
 
 		 765 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 837 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 759 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 751 aa  225  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 689 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 860 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 749 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 733 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 726 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 741 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 734 aa  224  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 724 aa  224  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 731 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 753 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 733 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  29.16 
 
 		 736 aa  219  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 712 aa  218  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 730 aa  217  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 734 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 736 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.87 
 
 		 711 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 741 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 730 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 730 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 730 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 817 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 738 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 710 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 829 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 826 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 733 aa  210  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 711 aa  210  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 730 aa  209  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 732 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 733 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 769 aa  209  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>