139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1897 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1897  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 		 294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  44.7 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  47.69 
 
 		 264 aa  226  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  46.1 
 
 		 285 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  45.42 
 
 		 530 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  43.17 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  42.86 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  44.73 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  43.82 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  43.38 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  38.46 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3755  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  40.45 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.08 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2173  DNA adenine methyltransferase  38.82 
 
 		 232 aa  159  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.134955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.72 
 
 		 673 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.16 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.32 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.9 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5555  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.17 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.74 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.67 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.67 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  30.96 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.49 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  26.42 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.92 
 
 		 263 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  30.67 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  26.42 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  26.72 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  27.11 
 
 		 253 aa  85.5  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  27.11 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  27.88 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  27.11 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.78 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.33 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  26.67 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.12 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.78 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.78 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  30.11 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.33 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  28.12 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.67 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.68 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  22.14 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.91 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  23.17 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  25.22 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  25.24 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  25.24 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  25.6 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.64 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  29.27 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  24.59 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.01 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  24.82 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  27.48 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.2 
 
 		 704 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  27.85 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  27.83 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  28.51 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  26.29 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  27.83 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  29.32 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  25.25 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3085  Site-specific DNA methylase protein  35.11 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.32 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6518  phage DNA methylase  40.7 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3756  DNA adenine methylase  27.32 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3790  DNA adenine methylase  27.32 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0828962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3681  DNA adenine methylase  27.32 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3683  DNA adenine methylase  27.32 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00514879  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3852  DNA adenine methylase  27.32 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  27.59 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  28.65 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3800  DNA adenine methylase  26.8 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  27.39 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  23.45 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  26.02 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  23.98 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  24.35 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  28 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  31.28 
 
 		 286 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  26.15 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  25.63 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  24.19 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3963  DNA adenine methylase  26.4 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3724  DNA adenine methylase  26.4 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00179541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0228  DNA adenine methylase  26.4 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0459983  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  26.5 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  26.9 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  26.9 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  24.35 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4258  phage DNA methylase  46.88 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0105966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  24.35 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  26.9 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  26.9 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  26.9 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  26.9 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>