More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1798 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  100 
 
 		 328 aa  659    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  95.43 
 
 		 328 aa  633  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  94.82 
 
 		 328 aa  630  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  88.04 
 
 		 327 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  80.06 
 
 		 330 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  82.84 
 
 		 328 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  72.43 
 
 		 328 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  64.9 
 
 		 323 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  66.23 
 
 		 328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  60.99 
 
 		 320 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  59.63 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  62.54 
 
 		 312 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  60.37 
 
 		 320 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  58.26 
 
 		 329 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  63.12 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  57.01 
 
 		 329 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  56.7 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  58.81 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0484  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  58.31 
 
 		 323 aa  361  9e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  53.89 
 
 		 334 aa  351  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  55.3 
 
 		 362 aa  348  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  54.97 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  54.79 
 
 		 324 aa  345  5e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  54.64 
 
 		 335 aa  345  7e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  56.11 
 
 		 329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  55.59 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  53.56 
 
 		 325 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  53.31 
 
 		 329 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  52.36 
 
 		 327 aa  322  8e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.68 
 
 		 326 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  49.67 
 
 		 318 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  40.62 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  41.08 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.75 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.19 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.03 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.02 
 
 		 345 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.6 
 
 		 344 aa  199  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.5 
 
 		 317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.28 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.98 
 
 		 689 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  34.09 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  34.65 
 
 		 580 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1667 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2474  hypothetical protein  32.39 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.686605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  32.57 
 
 		 387 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.89 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1302  hypothetical protein  32.93 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.127226  normal  0.259109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  33.22 
 
 		 810 aa  135  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.22 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  33.33 
 
 		 1094 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.6 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.04 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.7 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.21 
 
 		 354 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 		 752 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  31.96 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.57 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  31.5 
 
 		 479 aa  126  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.69 
 
 		 348 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.96 
 
 		 365 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  31.45 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.36 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.82 
 
 		 417 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6515  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.32 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.761865  normal  0.0861969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.2 
 
 		 415 aa  116  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  31.7 
 
 		 819 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.82 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.11 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.61 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.41 
 
 		 357 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.41 
 
 		 357 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5421  WD-40 repeat-containing protein  27.83 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31 
 
 		 451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 		 776 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.93 
 
 		 1170 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.16 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  32.43 
 
 		 971 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.62 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.3 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.23 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  29.7 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.33 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.33 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.33 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.65 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.43 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  28.81 
 
 		 556 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.14 
 
 		 314 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  28.98 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.75 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.72 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.98 
 
 		 607 aa  95.9  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.75 
 
 		 362 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.75 
 
 		 362 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.55 
 
 		 479 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.54 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.74 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>