50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1797 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  92.06 
 
 		 429 aa  793    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  92.16 
 
 		 422 aa  778    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  100 
 
 		 427 aa  861    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  79.89 
 
 		 423 aa  594  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  72.92 
 
 		 423 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  71.39 
 
 		 424 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  59.95 
 
 		 420 aa  461  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  50.15 
 
 		 367 aa  330  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  48.21 
 
 		 411 aa  330  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  47.99 
 
 		 400 aa  322  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  47.38 
 
 		 408 aa  319  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  45.23 
 
 		 397 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  47.11 
 
 		 408 aa  319  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  46.83 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  45.5 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  44.14 
 
 		 391 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  47.55 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  46.72 
 
 		 386 aa  310  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  45.45 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  45.48 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  45.25 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  45.58 
 
 		 393 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  46.69 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  41.47 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  42.86 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  40.46 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  37.68 
 
 		 408 aa  256  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  36.93 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  37.37 
 
 		 412 aa  246  6e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  36.53 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  36.49 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  36.94 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  37.5 
 
 		 406 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  38.51 
 
 		 402 aa  199  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  37.04 
 
 		 391 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  23.53 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1798  extracellular ligand-binding receptor  22.5 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  21.71 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2930  Extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0288888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3308  extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663851  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1797  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1054  amino acid-binding protein, putative  27.2 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000719773  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1770  putative leu/Ile/val-binding precursor signal peptide protein  23.47 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  22.29 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 		 411 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2931  extracellular ligand-binding receptor  22.11 
 
 		 409 aa  43.5  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.014925  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  20.6 
 
 		 375 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>