45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1791 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  100 
 
 
178 aa  360  8e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  84.83 
 
 
177 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  84.83 
 
 
177 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  58.06 
 
 
177 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  46.67 
 
 
179 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  48.41 
 
 
179 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  45.36 
 
 
187 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  45.81 
 
 
176 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  45.16 
 
 
176 aa  134  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  45.16 
 
 
176 aa  134  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  45.81 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  43.75 
 
 
175 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  43.87 
 
 
183 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  35.29 
 
 
176 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  37.82 
 
 
177 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  38.75 
 
 
173 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  34.64 
 
 
176 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  35.95 
 
 
177 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  39.51 
 
 
183 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  36.36 
 
 
176 aa  99  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  36.65 
 
 
185 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  34.73 
 
 
184 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  36 
 
 
174 aa  92  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  35.26 
 
 
181 aa  91.3  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  34.62 
 
 
176 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  38.61 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  28.81 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  33.33 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  33.33 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  34.48 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  36.7 
 
 
157 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  31.03 
 
 
157 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  32.85 
 
 
166 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  35.09 
 
 
195 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  33.61 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  30.36 
 
 
181 aa  52  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  31.19 
 
 
157 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  33.65 
 
 
138 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  33.65 
 
 
138 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  28.24 
 
 
168 aa  45.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  32.41 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  32.69 
 
 
138 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  28.66 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  31.43 
 
 
136 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  26.35 
 
 
168 aa  41.6  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>