57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1785 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 		 170 aa  349  8.999999999999999e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  98.82 
 
 		 170 aa  348  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  97.06 
 
 		 170 aa  340  8e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  97.06 
 
 		 170 aa  340  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  87.57 
 
 		 171 aa  310  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  86.98 
 
 		 171 aa  309  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  83.33 
 
 		 169 aa  293  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  72.19 
 
 		 170 aa  254  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  71.6 
 
 		 169 aa  254  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  71.01 
 
 		 169 aa  253  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  72.19 
 
 		 175 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  70.83 
 
 		 169 aa  246  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  69.23 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  68.64 
 
 		 170 aa  239  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  66.47 
 
 		 169 aa  228  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  60.38 
 
 		 165 aa  204  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  54.88 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  56.5 
 
 		 178 aa  190  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  54.72 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  57.3 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  58.49 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  48.72 
 
 		 396 aa  159  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  51.59 
 
 		 392 aa  151  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  46.5 
 
 		 393 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  52.23 
 
 		 392 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  42.31 
 
 		 393 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  42.95 
 
 		 403 aa  135  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  44.87 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  45.51 
 
 		 393 aa  120  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  36.05 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  34.69 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  29.81 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  30.38 
 
 		 190 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  35.43 
 
 		 183 aa  84.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  35.62 
 
 		 177 aa  84  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  32.88 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  32.88 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  32.88 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  32.19 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  32.19 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  32.19 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  34.36 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  30.14 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2778  formaldehyde-activating domain-containing protein  48.75 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  28.57 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  30.12 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  31.14 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000204771  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  29.19 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  29.19 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  29.19 
 
 		 167 aa  72  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  25.43 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  25.75 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  25.75 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  25.75 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  27.71 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  30.72 
 
 		 391 aa  64.7  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  25.15 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>