More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1747 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  96.52 
 
 		 402 aa  807    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  81.34 
 
 		 402 aa  685    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  96.52 
 
 		 402 aa  807    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  100 
 
 		 402 aa  829    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  69.08 
 
 		 417 aa  589  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  69.08 
 
 		 417 aa  586  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  66.84 
 
 		 396 aa  542  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  62.47 
 
 		 421 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  61.89 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  61.64 
 
 		 395 aa  484  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  55.47 
 
 		 391 aa  449  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  55.22 
 
 		 391 aa  448  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  51.42 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  52.56 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  52.2 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  52.45 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  53.4 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  51.04 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  51.16 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  51.03 
 
 		 401 aa  378  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  48.34 
 
 		 422 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  50 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  49.49 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  47.83 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  49.49 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  49.49 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  47.99 
 
 		 406 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  49.87 
 
 		 402 aa  360  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  47.58 
 
 		 406 aa  359  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  48.73 
 
 		 406 aa  358  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  47.33 
 
 		 406 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  48.7 
 
 		 398 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  46.33 
 
 		 406 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  46.94 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  48.71 
 
 		 401 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  46.68 
 
 		 415 aa  352  7e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  46.9 
 
 		 406 aa  349  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  46.68 
 
 		 399 aa  347  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  46.8 
 
 		 403 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  46.85 
 
 		 395 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  47.69 
 
 		 400 aa  335  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  44.67 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  44.22 
 
 		 413 aa  332  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  45.52 
 
 		 397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  45.94 
 
 		 397 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  45.71 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  45.78 
 
 		 397 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  46.63 
 
 		 397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  40.81 
 
 		 395 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  38.2 
 
 		 395 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  38.64 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  38.13 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  38.76 
 
 		 382 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  38.76 
 
 		 382 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  39.2 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  36.2 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  39.07 
 
 		 383 aa  255  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  38.56 
 
 		 388 aa  253  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  35.94 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  36.32 
 
 		 384 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  41.41 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  37.37 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  36.95 
 
 		 383 aa  242  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  35.22 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  37.21 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  37.99 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  35.05 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.88 
 
 		 387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.56 
 
 		 400 aa  236  8e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  34.2 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  36.95 
 
 		 382 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  34.02 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  38.2 
 
 		 382 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.68 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  33.93 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  34.65 
 
 		 382 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.18 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  35.52 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  32.9 
 
 		 384 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  32.9 
 
 		 384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  35.92 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  36.72 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  34.2 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.75 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  32.65 
 
 		 379 aa  222  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  32.65 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  36.18 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.9 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  36.18 
 
 		 362 aa  219  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  34.67 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  35.51 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  34.31 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  36.57 
 
 		 387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  36.34 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  34.81 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1888  aminotransferase, class V  37.43 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  35.23 
 
 		 381 aa  213  7e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0245  Serine-pyruvate aminotransferase/aspartate aminotransferase  37.17 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>