243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1735 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 310 aa  628  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  92.58 
 
 		 310 aa  592  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  92.58 
 
 		 310 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  71.61 
 
 		 320 aa  454  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  57.93 
 
 		 315 aa  358  6e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  44.82 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  48.57 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  45.77 
 
 		 315 aa  238  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  48.23 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  41.31 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  44.17 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  40.78 
 
 		 352 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  42.05 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  41.03 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  38.62 
 
 		 351 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  35.05 
 
 		 364 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  32.88 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  34.53 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  30.36 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  35.04 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  33.19 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  34.24 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  33.57 
 
 		 351 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  31.67 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  35.31 
 
 		 597 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  29.76 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  34.13 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  29.27 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 		 325 aa  99.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  22.45 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  27.2 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  30.65 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  30.36 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.3 
 
 		 318 aa  95.5  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 		 322 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  28.94 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.77 
 
 		 438 aa  89  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 332 aa  86.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  26.61 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  31.06 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  31.06 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  30.12 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  30.2 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  29.41 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  29.12 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  29.3 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  29.41 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  28.91 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  24.81 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  30.1 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  27.07 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  29.76 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  23.64 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.11 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  22.6 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  27.44 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.63 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>