More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1678 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  73.79 
 
 		 435 aa  669    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  85.71 
 
 		 421 aa  748    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  76.02 
 
 		 418 aa  658    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  85 
 
 		 421 aa  746    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  92.41 
 
 		 436 aa  817    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1563  transcription termination factor Rho  96.87 
 
 		 506 aa  850    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657404 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2892  transcription termination factor Rho  77.75 
 
 		 422 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 447 aa  904    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  84.96 
 
 		 421 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3453  transcription termination factor Rho  77.03 
 
 		 423 aa  672    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  85 
 
 		 421 aa  746    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  85.48 
 
 		 421 aa  745    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1231  transcription termination factor Rho  77.75 
 
 		 422 aa  677    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287939  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5019  transcription termination factor Rho  76.61 
 
 		 473 aa  699    Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000339489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  92.64 
 
 		 436 aa  820    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  96.25 
 
 		 428 aa  835    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  87.41 
 
 		 422 aa  758    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2668  transcription termination factor Rho  77.99 
 
 		 422 aa  678    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.169241  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  78.23 
 
 		 418 aa  701    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  85.24 
 
 		 421 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  84.76 
 
 		 421 aa  742    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  75.78 
 
 		 418 aa  667    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  73.82 
 
 		 424 aa  659    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  84.73 
 
 		 421 aa  742    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0198  transcription termination factor Rho  78.36 
 
 		 402 aa  652    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  84.52 
 
 		 421 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  85.24 
 
 		 421 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  84.76 
 
 		 421 aa  740    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2863  transcription termination factor Rho  76.9 
 
 		 423 aa  670    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2845  transcription termination factor Rho  75.78 
 
 		 418 aa  667    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  0.0341841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  82.86 
 
 		 429 aa  739    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  81.86 
 
 		 422 aa  719    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  84.25 
 
 		 421 aa  741    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  86.7 
 
 		 422 aa  749    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2532  transcription termination factor Rho  85.75 
 
 		 422 aa  745    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  85.44 
 
 		 421 aa  747    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  79.58 
 
 		 436 aa  711    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0009  transcription termination factor Rho  81.19 
 
 		 421 aa  713    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000017892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1842  transcription termination factor Rho  96.87 
 
 		 447 aa  852    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.660399 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  85.17 
 
 		 418 aa  743    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0002  transcription termination factor Rho  78.9 
 
 		 434 aa  679    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303251  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  69.23 
 
 		 418 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  69.47 
 
 		 418 aa  611  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  70.02 
 
 		 421 aa  610  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  69.71 
 
 		 418 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  69.23 
 
 		 418 aa  607  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  69.23 
 
 		 418 aa  607  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  69.95 
 
 		 419 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  70.26 
 
 		 415 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  601  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3189  transcription termination factor Rho  68.75 
 
 		 422 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0152106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  67.55 
 
 		 419 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  68.03 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  67.31 
 
 		 419 aa  599  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  67.55 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  67.55 
 
 		 419 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  67.55 
 
 		 450 aa  599  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  68.03 
 
 		 419 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  70.33 
 
 		 415 aa  599  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  67.87 
 
 		 418 aa  600  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  68.27 
 
 		 419 aa  598  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  68.03 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  67.31 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  67.55 
 
 		 419 aa  598  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  68.03 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  67.55 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  67.55 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  67.55 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  67.55 
 
 		 419 aa  598  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  68.03 
 
 		 421 aa  598  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  67.55 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  67.31 
 
 		 419 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  68.03 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  67.87 
 
 		 418 aa  600  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  69.54 
 
 		 415 aa  595  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  67.07 
 
 		 419 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  67.94 
 
 		 415 aa  594  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  67.31 
 
 		 419 aa  595  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  67.07 
 
 		 419 aa  595  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0511  transcription termination factor Rho  67.55 
 
 		 419 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0322242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  67.31 
 
 		 450 aa  597  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0180  transcription termination factor Rho  67.55 
 
 		 419 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0188  transcription termination factor Rho  68.27 
 
 		 419 aa  596  1e-169  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4034  transcription termination factor Rho  67.55 
 
 		 419 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  68.66 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0176  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 419 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1990  transcription termination factor Rho  67.31 
 
 		 435 aa  592  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  68.35 
 
 		 415 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>