More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1663 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1663  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1576  response regulator receiver  98.68 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  0.0547836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1855  two component transcriptional regulator, winged helix family  98.68 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1399  two component transcriptional regulator  80.26 
 
 		 228 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1017  two component transcriptional regulator, winged helix family  79.82 
 
 		 228 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4105  two component transcriptional regulator  78.95 
 
 		 228 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0332  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.35 
 
 		 228 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1771  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 		 228 aa  315  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.046286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0229  two component transcriptional regulator  64.47 
 
 		 228 aa  315  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444604  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3424  two component transcriptional regulator  65.49 
 
 		 227 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0965  two component transcriptional regulator  62.78 
 
 		 227 aa  305  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2006  DNA-binding response regulator  62.33 
 
 		 227 aa  304  9.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.347503  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1929  DNA-binding response regulator  62.33 
 
 		 227 aa  304  9.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3763  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.02 
 
 		 227 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0087  transcriptional regulatory protein  63.76 
 
 		 228 aa  299  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.701272  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0280  two component transcriptional regulator  63.76 
 
 		 228 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0381  two component transcriptional regulator  64.19 
 
 		 228 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.638697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0440  winged helix family two component transcriptional regulator  64.19 
 
 		 228 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0286  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.76 
 
 		 228 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1289  two component transcriptional regulator  62.28 
 
 		 240 aa  295  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101499  normal  0.741023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4088  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.23 
 
 		 227 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3056  two component transcriptional regulator  64.13 
 
 		 253 aa  293  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4227  two component response regulator  63.68 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0109817  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2950  two component transcriptional regulator  61.06 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5036  two component transcriptional regulator  67.14 
 
 		 232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0177  two component transcriptional regulator  62.72 
 
 		 228 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0051  two component transcriptional regulator  59.47 
 
 		 228 aa  281  7.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0417  two component transcriptional regulator  59.47 
 
 		 228 aa  280  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0094  two component transcriptional regulator  60.96 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402679  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0038  two component transcriptional regulator  58.59 
 
 		 228 aa  271  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2374  two component transcriptional regulator  57.27 
 
 		 228 aa  271  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3128  two component transcriptional regulator  58.15 
 
 		 228 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  hitchhiker  0.000183133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0847  two component transcriptional regulator  58.59 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2505  two component transcriptional regulator  58.59 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472327  normal  0.764107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0059  DNA-binding response regulator  51.57 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2814  two component transcriptional regulator  54.94 
 
 		 240 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.84 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.164674  normal  0.0215513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3638  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 270 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  37 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  37 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  37 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  37 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  37 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  37 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  37 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  37 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  37 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  36.29 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0367  response regulator receiver  36.48 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  39.91 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.06 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.65 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.22 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.81 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  36.09 
 
 		 254 aa  128  6e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  40.38 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  36.24 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  36.44 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.71 
 
 		 240 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1160  transcriptional regulatory protein YedW  42.31 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  36.16 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1191  transcriptional regulatory protein YedW  42.31 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.09 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1055  transcriptional regulatory protein YedW  42.31 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1171  transcriptional regulatory protein YedW  42.31 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  33.03 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  32.58 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  33.03 
 
 		 224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  35.32 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  38.5 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 242 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0465  DNA-binding response regulator  36.8 
 
 		 230 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000321608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>