More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1654 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  96.4 
 
 
286 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  96.4 
 
 
286 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4093  cobyrinic acid ac-diamide synthase  86.47 
 
 
285 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.164046  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1408  cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.95 
 
 
279 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.391626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  82.05 
 
 
282 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  76.05 
 
 
284 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  74.05 
 
 
289 aa  401  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  74.9 
 
 
271 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  74.71 
 
 
286 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.36 
 
 
282 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  74.52 
 
 
284 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  75.29 
 
 
284 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.56 
 
 
282 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  73.36 
 
 
283 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  70.7 
 
 
262 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.39 
 
 
317 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  68.7 
 
 
264 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  70 
 
 
265 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  70 
 
 
265 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.53 
 
 
264 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.14 
 
 
264 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.14 
 
 
264 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  68.36 
 
 
264 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  68.06 
 
 
265 aa  367  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.11 
 
 
270 aa  360  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  63.18 
 
 
276 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  63.88 
 
 
285 aa  337  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.2 
 
 
263 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  53.1 
 
 
255 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  58.89 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  52.71 
 
 
256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.39 
 
 
260 aa  301  6.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  58.33 
 
 
258 aa  300  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  58.75 
 
 
268 aa  292  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  57.98 
 
 
259 aa  291  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.73 
 
 
255 aa  285  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.94 
 
 
279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.34 
 
 
265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.79 
 
 
257 aa  281  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.25 
 
 
258 aa  281  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  51.94 
 
 
258 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.76 
 
 
253 aa  279  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.06 
 
 
273 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  50.78 
 
 
257 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.75 
 
 
255 aa  277  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.12 
 
 
253 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  50.97 
 
 
256 aa  277  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.76 
 
 
253 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  49.61 
 
 
253 aa  276  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  55.34 
 
 
270 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.26 
 
 
295 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 
257 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  51.75 
 
 
262 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  50.39 
 
 
249 aa  275  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 
257 aa  275  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  50.92 
 
 
280 aa  275  6e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  51.57 
 
 
254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  55.89 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.89 
 
 
274 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  52.96 
 
 
253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.57 
 
 
253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.57 
 
 
253 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.44 
 
 
270 aa  272  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.76 
 
 
262 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  49.81 
 
 
264 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
253 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  49.22 
 
 
273 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.78 
 
 
253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.78 
 
 
253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.78 
 
 
253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  51.78 
 
 
253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  51.78 
 
 
253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.78 
 
 
253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.78 
 
 
253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.78 
 
 
253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.78 
 
 
253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  50.2 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  50.58 
 
 
262 aa  268  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.55 
 
 
264 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  48.84 
 
 
265 aa  267  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  49.61 
 
 
265 aa  267  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
284 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.02 
 
 
253 aa  266  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  49.02 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  50.75 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  48.84 
 
 
257 aa  265  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.44 
 
 
257 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.36 
 
 
259 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.56 
 
 
256 aa  264  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.36 
 
 
259 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.56 
 
 
257 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  51.37 
 
 
259 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.39 
 
 
254 aa  262  6e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.77 
 
 
262 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.87 
 
 
264 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.84 
 
 
265 aa  261  8.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 
314 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  51.16 
 
 
260 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.54 
 
 
266 aa  260  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>