26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1615 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1615  protein of unknown function DUF1150  100 
 
 
98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0149987  hitchhiker  0.0025404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1903  protein of unknown function DUF1150  91.84 
 
 
93 aa  175  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1621  hypothetical protein  91.84 
 
 
93 aa  175  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3161  hypothetical protein  77.65 
 
 
94 aa  127  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243875  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4229  hypothetical protein  68.29 
 
 
83 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4739  protein of unknown function DUF1150  68.42 
 
 
83 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2033  hypothetical protein  61.9 
 
 
89 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0055  protein of unknown function DUF1150  56.38 
 
 
88 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0116  hypothetical protein  55.95 
 
 
87 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0181  hypothetical protein  63.16 
 
 
88 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.489602  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0652  hypothetical protein  61.04 
 
 
88 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0507627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0410  hypothetical protein  53.12 
 
 
87 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0513  hypothetical protein  54.02 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0212  hypothetical protein  54.76 
 
 
88 aa  94  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0168  hypothetical protein  61.97 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1373  protein of unknown function DUF1150  59.72 
 
 
88 aa  90.5  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0048  hypothetical protein  48.05 
 
 
85 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725012  hitchhiker  0.0000000457362 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0156  hypothetical protein  55.56 
 
 
81 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3664  hypothetical protein  51.39 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.805685  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0162  hypothetical protein  55.56 
 
 
81 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0011  protein of unknown function DUF1150  46.25 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0446  hypothetical protein  48.75 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0173  hypothetical protein  54.17 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441398  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0011  protein of unknown function DUF1150  45 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0617045  normal  0.0877122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4962  hypothetical protein  38.1 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.780317  normal  0.980249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0407  hypothetical protein  35.53 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>