191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1596 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
472 aa  920    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  57.5 
 
 
440 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  57.43 
 
 
444 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.2 
 
 
444 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  54.55 
 
 
442 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  52.28 
 
 
442 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  45.41 
 
 
452 aa  361  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.47 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  48.56 
 
 
464 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  46.62 
 
 
433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.9 
 
 
432 aa  339  8e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  38.78 
 
 
443 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  39.13 
 
 
430 aa  325  1e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  37.93 
 
 
436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  46.65 
 
 
452 aa  318  9e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  44.87 
 
 
432 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.27 
 
 
454 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  43.27 
 
 
462 aa  300  4e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.75 
 
 
437 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  45.14 
 
 
455 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  41.99 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.49 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.15 
 
 
433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  44.44 
 
 
444 aa  282  9e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  41.31 
 
 
432 aa  279  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.97 
 
 
440 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  40.42 
 
 
438 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  43.71 
 
 
437 aa  276  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  38.14 
 
 
457 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  38.14 
 
 
457 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  40.89 
 
 
481 aa  266  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  43.91 
 
 
432 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  41.23 
 
 
436 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.78 
 
 
433 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.42 
 
 
453 aa  263  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  37.97 
 
 
456 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 
456 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 
456 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  43.75 
 
 
438 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  41.38 
 
 
438 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.36 
 
 
447 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.5 
 
 
472 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.15 
 
 
463 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  43.55 
 
 
438 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  31.92 
 
 
425 aa  226  9e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  35.03 
 
 
474 aa  221  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  35.01 
 
 
476 aa  219  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  34.73 
 
 
461 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.11 
 
 
441 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  30.92 
 
 
431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  29.78 
 
 
431 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.6 
 
 
445 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  38.94 
 
 
478 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  38.94 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.94 
 
 
490 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  38.94 
 
 
478 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  38.94 
 
 
478 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  38.94 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  38.05 
 
 
468 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  38.05 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  36.28 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  36.28 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  34.78 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  34.97 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1591  twin-arginine translocation pathway signal  25.19 
 
 
497 aa  63.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190202  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  28.5 
 
 
491 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  33.96 
 
 
378 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  28.44 
 
 
495 aa  60.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  29.93 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  24.4 
 
 
437 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  30.91 
 
 
481 aa  57.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  26.23 
 
 
578 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  29.2 
 
 
432 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  28.93 
 
 
441 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.07 
 
 
462 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.03 
 
 
474 aa  54.3  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  28.92 
 
 
434 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  33.8 
 
 
447 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.05 
 
 
485 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 
483 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.85 
 
 
482 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  30.27 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  29.83 
 
 
484 aa  50.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  26.99 
 
 
761 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.25 
 
 
472 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.87 
 
 
496 aa  50.4  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  27.15 
 
 
499 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  32.28 
 
 
520 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  33.87 
 
 
437 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.2 
 
 
488 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  28.34 
 
 
499 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.86 
 
 
467 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  26.09 
 
 
574 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.74 
 
 
404 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  31.4 
 
 
495 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.93 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  31.58 
 
 
437 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  39.44 
 
 
452 aa  47.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  25.23 
 
 
418 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  29.69 
 
 
472 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>