110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1554 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  100 
 
 
2363 aa  4273    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  38.41 
 
 
1571 aa  231  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  30.73 
 
 
2578 aa  215  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  40.43 
 
 
3506 aa  210  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  35.05 
 
 
1593 aa  182  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  34.26 
 
 
2906 aa  173  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.79 
 
 
3629 aa  145  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  35.64 
 
 
1508 aa  142  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  33.54 
 
 
1971 aa  132  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.47 
 
 
1227 aa  132  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  34.74 
 
 
2396 aa  131  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  34.44 
 
 
3420 aa  130  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  30.31 
 
 
1881 aa  128  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  34.04 
 
 
3415 aa  124  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  38.5 
 
 
1108 aa  122  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  34.32 
 
 
1882 aa  122  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  42.02 
 
 
1113 aa  121  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  36.97 
 
 
2346 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  35.25 
 
 
994 aa  121  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  37.12 
 
 
2365 aa  120  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  35.28 
 
 
1119 aa  118  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.92 
 
 
1285 aa  114  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  30.43 
 
 
1861 aa  113  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  36.07 
 
 
1068 aa  112  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.58 
 
 
1357 aa  112  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.05 
 
 
1848 aa  107  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  33.08 
 
 
2711 aa  106  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  33.54 
 
 
1458 aa  103  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  34.42 
 
 
1446 aa  102  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  33.73 
 
 
1325 aa  100  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.69 
 
 
1322 aa  95.9  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  47.22 
 
 
2642 aa  94.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  38.74 
 
 
1459 aa  93.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  37.79 
 
 
2366 aa  93.6  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  39.11 
 
 
2371 aa  92.8  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.97 
 
 
1532 aa  92.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  34.77 
 
 
1741 aa  91.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  30.45 
 
 
1530 aa  87.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.21 
 
 
1081 aa  88.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  36.9 
 
 
995 aa  87.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  30.72 
 
 
1519 aa  87.4  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.58 
 
 
1029 aa  85.9  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  34.66 
 
 
986 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  36.62 
 
 
3391 aa  85.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.65 
 
 
1011 aa  83.2  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  32.93 
 
 
2003 aa  82.8  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  40.93 
 
 
1111 aa  80.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  32.76 
 
 
1180 aa  79.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  41.67 
 
 
983 aa  78.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  41.84 
 
 
1130 aa  77.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  39.87 
 
 
995 aa  78.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  41.08 
 
 
1164 aa  78.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  38.92 
 
 
950 aa  77.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  41.09 
 
 
2407 aa  76.3  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  45.9 
 
 
1055 aa  74.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  40 
 
 
1028 aa  73.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  30.74 
 
 
1019 aa  73.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  38.22 
 
 
1001 aa  73.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  38.46 
 
 
1001 aa  72.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  38.61 
 
 
991 aa  72.4  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  35.99 
 
 
1165 aa  71.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  36.4 
 
 
861 aa  71.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  35.99 
 
 
1165 aa  71.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  36.57 
 
 
1033 aa  70.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  35.08 
 
 
1004 aa  68.6  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  38.71 
 
 
1038 aa  68.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  39.34 
 
 
2926 aa  67.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  32 
 
 
550 aa  67.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  39.41 
 
 
1053 aa  66.6  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  33.71 
 
 
987 aa  66.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  31.97 
 
 
650 aa  66.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  36.82 
 
 
3089 aa  65.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  42.47 
 
 
1093 aa  64.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  42.47 
 
 
1093 aa  64.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  30.13 
 
 
3322 aa  63.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.75 
 
 
919 aa  63.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  42.96 
 
 
1099 aa  63.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  36.72 
 
 
852 aa  63.2  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  34.85 
 
 
1115 aa  60.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  30.53 
 
 
1172 aa  60.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.9 
 
 
1055 aa  60.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  36.42 
 
 
677 aa  59.7  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  41.67 
 
 
4238 aa  59.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  32.92 
 
 
1806 aa  58.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  33.33 
 
 
2057 aa  58.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  51.04 
 
 
816 aa  57.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  38.46 
 
 
1632 aa  57.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  38.1 
 
 
1300 aa  57.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  53.25 
 
 
860 aa  57.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  33.1 
 
 
1806 aa  57  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  33.1 
 
 
1626 aa  55.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.2 
 
 
3015 aa  55.5  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  33.33 
 
 
942 aa  54.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.58 
 
 
972 aa  52  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.09 
 
 
1489 aa  52  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  33.33 
 
 
3822 aa  51.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 
4238 aa  51.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  33.33 
 
 
1177 aa  50.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  30.73 
 
 
882 aa  49.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  33.9 
 
 
422 aa  49.7  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>