More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1381 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 223 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  97.31 
 
 		 223 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  97.31 
 
 		 223 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  68.54 
 
 		 251 aa  286  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  72.77 
 
 		 217 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  70.32 
 
 		 218 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 226 aa  224  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  55.66 
 
 		 216 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  54.29 
 
 		 216 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  53.99 
 
 		 218 aa  211  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 220 aa  204  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  53.08 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  51.89 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  53.49 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  55.09 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  49.51 
 
 		 218 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 222 aa  181  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  47.09 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  46.38 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  46.86 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 242 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  46.94 
 
 		 237 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  46.83 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 244 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 243 aa  157  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  43.63 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  47 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  43.87 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  40.89 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  41.55 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  40.29 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  38.8 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  38.59 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 238 aa  98.2  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  37.77 
 
 		 274 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  36.02 
 
 		 263 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  37.16 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 260 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  34.65 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  35.55 
 
 		 263 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 267 aa  95.1  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>