More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1377 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 713 aa  1429    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  75.79 
 
 		 706 aa  1052    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  56.02 
 
 		 698 aa  790    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  91.64 
 
 		 717 aa  1323    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  57.22 
 
 		 700 aa  813    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  75.81 
 
 		 702 aa  1090    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  56.49 
 
 		 733 aa  775    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  91.34 
 
 		 715 aa  1319    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  79.34 
 
 		 716 aa  1125    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  43.06 
 
 		 714 aa  555  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  44.95 
 
 		 681 aa  498  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  40.72 
 
 		 727 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  40.48 
 
 		 742 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  36.56 
 
 		 737 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  37.68 
 
 		 736 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  38.68 
 
 		 726 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  37.2 
 
 		 734 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  42.28 
 
 		 664 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  38.62 
 
 		 692 aa  429  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  36.87 
 
 		 681 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  36.32 
 
 		 678 aa  353  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  33.57 
 
 		 712 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 688 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  31.79 
 
 		 690 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 690 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 800 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 708 aa  230  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 718 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  31.28 
 
 		 715 aa  224  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 720 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 739 aa  213  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 712 aa  213  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 702 aa  208  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 787 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 740 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 785 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 786 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 688 aa  151  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 776 aa  150  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 776 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 680 aa  143  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 731 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 675 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 774 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 		 728 aa  133  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  25.5 
 
 		 691 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 709 aa  129  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 697 aa  125  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 694 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 680 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 706 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 705 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 715 aa  116  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.32 
 
 		 726 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 791 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 678 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 723 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 700 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  25.04 
 
 		 706 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  25.12 
 
 		 721 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 791 aa  110  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.04 
 
 		 706 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25.04 
 
 		 706 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 682 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  25.16 
 
 		 706 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 700 aa  108  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.21 
 
 		 700 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.21 
 
 		 700 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 700 aa  107  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 700 aa  107  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 780 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 688 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 700 aa  105  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 705 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 742 aa  103  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 770 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.49 
 
 		 712 aa  99.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 720 aa  99.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 700 aa  97.4  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.22 
 
 		 681 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  22.96 
 
 		 762 aa  96.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 687 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  21.32 
 
 		 696 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 703 aa  93.6  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 698 aa  91.3  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 801 aa  91.3  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 		 715 aa  90.9  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 718 aa  89.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 778 aa  89  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  22.38 
 
 		 731 aa  87.4  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  23.34 
 
 		 710 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.01 
 
 		 712 aa  87  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 700 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  22.1 
 
 		 706 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  24.44 
 
 		 774 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 769 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  24.57 
 
 		 717 aa  81.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  22.37 
 
 		 716 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>