More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1333 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  83.79 
 
 		 560 aa  890    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  98.34 
 
 		 556 aa  1080    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  75.18 
 
 		 544 aa  838    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 543 aa  1090    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  98.34 
 
 		 543 aa  1080    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  75.37 
 
 		 544 aa  844    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  48.3 
 
 		 546 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  41.59 
 
 		 559 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  40.24 
 
 		 581 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  40.94 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  43.96 
 
 		 586 aa  415  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.58 
 
 		 561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  41.05 
 
 		 568 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.38 
 
 		 584 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  40.33 
 
 		 560 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.21 
 
 		 559 aa  395  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  41.01 
 
 		 582 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  38.66 
 
 		 582 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  39.66 
 
 		 582 aa  381  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  39.24 
 
 		 591 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  41.34 
 
 		 592 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.69 
 
 		 558 aa  365  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  43.78 
 
 		 501 aa  348  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.18 
 
 		 559 aa  343  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.26 
 
 		 501 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  34.61 
 
 		 561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  33.52 
 
 		 561 aa  324  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.61 
 
 		 561 aa  324  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  34.49 
 
 		 560 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  34.31 
 
 		 560 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  36.4 
 
 		 557 aa  310  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.78 
 
 		 563 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  34.24 
 
 		 599 aa  306  9.000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  31.8 
 
 		 558 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  33.76 
 
 		 565 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  34.89 
 
 		 551 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  34.35 
 
 		 552 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  34.76 
 
 		 562 aa  290  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  30.24 
 
 		 558 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  32.9 
 
 		 557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.32 
 
 		 559 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.51 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  32.84 
 
 		 552 aa  273  7e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5398  hypothetical protein  43.67 
 
 		 538 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  32.29 
 
 		 558 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  31.82 
 
 		 558 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  30.42 
 
 		 564 aa  265  2e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.42 
 
 		 509 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.01 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  36.4 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  34.03 
 
 		 557 aa  263  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.76 
 
 		 504 aa  263  8.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.15 
 
 		 559 aa  261  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.2 
 
 		 557 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  34.03 
 
 		 557 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  34.14 
 
 		 559 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  35.82 
 
 		 544 aa  257  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.57 
 
 		 559 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  31.86 
 
 		 556 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.59 
 
 		 525 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.59 
 
 		 525 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.97 
 
 		 551 aa  252  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.32 
 
 		 525 aa  251  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.32 
 
 		 525 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.32 
 
 		 525 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.32 
 
 		 525 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.41 
 
 		 525 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  34.13 
 
 		 560 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.41 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.44 
 
 		 557 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.93 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.93 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.27 
 
 		 522 aa  248  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.4 
 
 		 552 aa  248  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.27 
 
 		 506 aa  247  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  32.6 
 
 		 544 aa  247  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.41 
 
 		 552 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  30.07 
 
 		 558 aa  246  6e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  32.79 
 
 		 550 aa  246  8e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  34.36 
 
 		 652 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.78 
 
 		 549 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.78 
 
 		 549 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  35.43 
 
 		 556 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  33.12 
 
 		 549 aa  243  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.23 
 
 		 573 aa  243  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.78 
 
 		 549 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.78 
 
 		 549 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  31.43 
 
 		 547 aa  242  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.54 
 
 		 514 aa  242  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  30.75 
 
 		 563 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.17 
 
 		 525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  32.7 
 
 		 549 aa  239  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  30.61 
 
 		 555 aa  239  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3727  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.78 
 
 		 549 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.03 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.92 
 
 		 555 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.65 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.33 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.93 
 
 		 544 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.37 
 
 		 553 aa  237  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>