More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1262 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 204 aa  394  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  84.8 
 
 		 201 aa  331  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  68.97 
 
 		 200 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 261 aa  238  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  53.46 
 
 		 261 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  46.83 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  45.15 
 
 		 199 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  42 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  38.24 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  37.62 
 
 		 261 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.07 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 274 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  39.11 
 
 		 233 aa  97.8  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 		 273 aa  95.9  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  37.38 
 
 		 275 aa  95.5  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 		 245 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 228 aa  91.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  36.63 
 
 		 235 aa  91.7  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 		 238 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 		 238 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 		 238 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  37.23 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  36.79 
 
 		 230 aa  87.8  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  35.51 
 
 		 245 aa  81.3  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  33 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.98 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  35.58 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 411 aa  75.1  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  39.73 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.42 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.98 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  35.68 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 412 aa  72  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 402 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  32.52 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  33.71 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.67 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.33 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0462  Phosphoglycerate mutase  41.74 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  33.83 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 391 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  31.5 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.11 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  31.5 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  31.5 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  35.17 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>