61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1205 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  87.5 
 
 
219 aa  338  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  87.5 
 
 
219 aa  338  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  82.74 
 
 
220 aa  280  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  71.92 
 
 
207 aa  267  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  65.38 
 
 
207 aa  248  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  42.93 
 
 
208 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  45.76 
 
 
179 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  43.17 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  42.86 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  42.08 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  40.76 
 
 
203 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  40.76 
 
 
203 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  40.76 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  38.98 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  42.46 
 
 
191 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  39.11 
 
 
185 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  44.57 
 
 
186 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  41.87 
 
 
215 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  37.71 
 
 
190 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  41.67 
 
 
192 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  41.62 
 
 
191 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  39.77 
 
 
193 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  39.46 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  40.33 
 
 
186 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  38.86 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  38.42 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  38.29 
 
 
194 aa  82  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  40.12 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  32.56 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  33.16 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  37.43 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  32.02 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  29.67 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7759  hypothetical protein  35.48 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00223773  normal  0.120642 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  34.81 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  27.72 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  33.55 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  26.95 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  27.42 
 
 
177 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  29.89 
 
 
184 aa  55.1  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  30.65 
 
 
185 aa  55.1  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  24.02 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  31.32 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  30.52 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  30.52 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  30.52 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  32.76 
 
 
190 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  33.02 
 
 
417 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  34.09 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  30.83 
 
 
175 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1165  hypothetical protein  27.08 
 
 
201 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.912906  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  25.34 
 
 
189 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  26.62 
 
 
177 aa  46.2  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  32.26 
 
 
196 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  27.5 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  26.88 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  25 
 
 
174 aa  43.9  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2336  hypothetical protein  32.71 
 
 
164 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4412  hypothetical protein  31.21 
 
 
189 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  32.84 
 
 
192 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>