More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1188 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  100 
 
 
315 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  62.06 
 
 
327 aa  329  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  58.92 
 
 
317 aa  318  7e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  53.63 
 
 
316 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  52.53 
 
 
318 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  51.58 
 
 
318 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  50.48 
 
 
318 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  53.05 
 
 
326 aa  266  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  50.96 
 
 
318 aa  259  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  48.23 
 
 
322 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  53.67 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  53.67 
 
 
328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  53.99 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  49.4 
 
 
349 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  44.84 
 
 
330 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  48.06 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4251  ribokinase-like domain-containing protein  47.53 
 
 
331 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.598338  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  40.19 
 
 
312 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  45.34 
 
 
315 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  43.95 
 
 
315 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  39.3 
 
 
317 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  39.55 
 
 
312 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  43.31 
 
 
315 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  43.95 
 
 
315 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  39.3 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  39.23 
 
 
312 aa  196  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  39.62 
 
 
312 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  38.91 
 
 
312 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  37.94 
 
 
312 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  37.94 
 
 
312 aa  192  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  37.94 
 
 
312 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  37.94 
 
 
312 aa  192  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  37.94 
 
 
312 aa  192  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  37.94 
 
 
312 aa  192  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  37.94 
 
 
312 aa  192  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  34.62 
 
 
310 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  42.32 
 
 
313 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  37.62 
 
 
312 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  37.94 
 
 
312 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  37.94 
 
 
312 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  37.94 
 
 
312 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  37.94 
 
 
312 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  37.94 
 
 
312 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  35.78 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  35.78 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  38.59 
 
 
312 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  38.59 
 
 
312 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  38.59 
 
 
312 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  34.62 
 
 
311 aa  189  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  38.34 
 
 
323 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  38.14 
 
 
312 aa  189  5.999999999999999e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  38.66 
 
 
325 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  37.62 
 
 
312 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  42.81 
 
 
315 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  40.26 
 
 
313 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  42.81 
 
 
314 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  40.79 
 
 
308 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  39.62 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  40.89 
 
 
308 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  38.44 
 
 
310 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  42.22 
 
 
306 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  39.94 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  40.69 
 
 
322 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  32.69 
 
 
306 aa  169  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  40.06 
 
 
314 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  35.26 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  40.68 
 
 
315 aa  159  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  31.31 
 
 
311 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  42.55 
 
 
333 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  33.09 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  37.7 
 
 
314 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  32.91 
 
 
303 aa  152  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  30.77 
 
 
306 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  31.09 
 
 
303 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  40.91 
 
 
316 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  32.59 
 
 
303 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  31.55 
 
 
316 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  29.9 
 
 
308 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.27 
 
 
303 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  31.53 
 
 
308 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.49 
 
 
315 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  34.94 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  30.03 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  32.27 
 
 
303 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.27 
 
 
303 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  32.27 
 
 
303 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  32.27 
 
 
303 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  32.27 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  40.86 
 
 
308 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  32.27 
 
 
303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  29.81 
 
 
310 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  31.95 
 
 
303 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  37.12 
 
 
319 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  33.54 
 
 
303 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  37.12 
 
 
319 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  37.38 
 
 
325 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  35.24 
 
 
312 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  31.65 
 
 
304 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  39.02 
 
 
336 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  29.81 
 
 
306 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>