More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1151 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  84.38 
 
 		 424 aa  684    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  90.78 
 
 		 436 aa  739    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 441 aa  892    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  86.24 
 
 		 425 aa  678    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  91.41 
 
 		 432 aa  738    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  84.13 
 
 		 424 aa  672    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  63.49 
 
 		 437 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  66.27 
 
 		 436 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  66.03 
 
 		 436 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  66.27 
 
 		 436 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  68.49 
 
 		 439 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  63.66 
 
 		 437 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  65.28 
 
 		 436 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  66 
 
 		 437 aa  554  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  63.84 
 
 		 441 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  63.01 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  63.7 
 
 		 437 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  63.47 
 
 		 437 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  65.95 
 
 		 441 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  65.92 
 
 		 430 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  66.5 
 
 		 419 aa  525  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  71.64 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  60.48 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  59.4 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  57.92 
 
 		 431 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  61.54 
 
 		 441 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  59.06 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  60.57 
 
 		 441 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  60.57 
 
 		 441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  55.58 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  59.06 
 
 		 444 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  57.83 
 
 		 443 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  56.49 
 
 		 432 aa  461  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  56 
 
 		 432 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  56 
 
 		 432 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  56.3 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  56.3 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  55.5 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  55.66 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  55.18 
 
 		 447 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  61.98 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  61.56 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  54.25 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  56.12 
 
 		 443 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  52.27 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  57.71 
 
 		 443 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  56.1 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  48.75 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  40 
 
 		 438 aa  279  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 431 aa  270  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  32.93 
 
 		 430 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 408 aa  150  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 416 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 418 aa  145  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.88 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 407 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.46 
 
 		 402 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.21 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.53 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  25.95 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 405 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  26.81 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 402 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.21 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  26.21 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.81 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  29.21 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  25.7 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  25.7 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 418 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  28.71 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 421 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 436 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 442 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 379 aa  130  7.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 415 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  28.8 
 
 		 401 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 382 aa  128  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 421 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  24.94 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  24.57 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  24.57 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>