More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1048 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
559 aa  1100    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 
558 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  44.74 
 
 
608 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  45.29 
 
 
558 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
573 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.72 
 
 
567 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.4 
 
 
561 aa  359  7e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.12 
 
 
563 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.12 
 
 
579 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.39 
 
 
567 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.04 
 
 
563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  39.86 
 
 
565 aa  329  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.34 
 
 
565 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 
586 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.7 
 
 
560 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 
559 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.22 
 
 
575 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 
736 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.75 
 
 
562 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  37.1 
 
 
566 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.48 
 
 
561 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  36.07 
 
 
661 aa  294  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.51 
 
 
561 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.02 
 
 
561 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4791  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.16 
 
 
563 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.685315  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1583  chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 
583 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.105257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 
562 aa  281  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
561 aa  279  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 
561 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.81 
 
 
663 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00859167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.04 
 
 
561 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.29 
 
 
549 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.482626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.34 
 
 
694 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3836  Cache, type 2  36.75 
 
 
661 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337162  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  35.26 
 
 
565 aa  269  8e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.89 
 
 
563 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 
560 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  46.11 
 
 
691 aa  267  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
688 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1584  chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 
556 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
563 aa  266  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  43.9 
 
 
688 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.72 
 
 
675 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.82 
 
 
561 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.92 
 
 
731 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
563 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 
670 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5132  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.78 
 
 
564 aa  262  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315031  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4669  chemotaxis sensory transducer  47.5 
 
 
564 aa  261  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  40.58 
 
 
568 aa  259  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 
561 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.82 
 
 
711 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.82 
 
 
567 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 
689 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.77 
 
 
561 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.58 
 
 
568 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  44.04 
 
 
563 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.53 
 
 
563 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.82 
 
 
566 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.11 
 
 
712 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 
561 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.36 
 
 
730 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  43.54 
 
 
712 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.24 
 
 
560 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.71 
 
 
691 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  42.25 
 
 
688 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  45.07 
 
 
561 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.4 
 
 
563 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.97 
 
 
566 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
674 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.38 
 
 
712 aa  253  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.24 
 
 
688 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.97 
 
 
691 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 
567 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.92 
 
 
563 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.11 
 
 
562 aa  250  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  46.42 
 
 
561 aa  250  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  40.44 
 
 
563 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  42.55 
 
 
577 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  44.38 
 
 
566 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.28 
 
 
559 aa  250  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.9 
 
 
563 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.07 
 
 
563 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
672 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  44.04 
 
 
676 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.89 
 
 
673 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.58 
 
 
656 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  46.53 
 
 
562 aa  247  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.72 
 
 
655 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.17 
 
 
561 aa  247  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.54 
 
 
568 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  46.17 
 
 
561 aa  246  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  43.56 
 
 
565 aa  246  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.41 
 
 
564 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.44 
 
 
587 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 
655 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.7 
 
 
689 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  42.59 
 
 
563 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  43.63 
 
 
561 aa  244  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.2 
 
 
561 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>