More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0940 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  73.89 
 
 
430 aa  651  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  76.57 
 
 
431 aa  665  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  76.62 
 
 
432 aa  682  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  74.42 
 
 
429 aa  664  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  74.54 
 
 
432 aa  674  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  73.61 
 
 
432 aa  662  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  75.99 
 
 
430 aa  670  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  79.07 
 
 
430 aa  683  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  97.67 
 
 
430 aa  850  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  77.96 
 
 
431 aa  684  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  72.79 
 
 
430 aa  652  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  73.02 
 
 
448 aa  650  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  100 
 
 
430 aa  867  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  75.46 
 
 
432 aa  679  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  75.06 
 
 
430 aa  664  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  74.36 
 
 
430 aa  662  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  75.93 
 
 
432 aa  681  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  97.44 
 
 
448 aa  850  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  79.07 
 
 
430 aa  683  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  80.23 
 
 
430 aa  697  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  75.06 
 
 
457 aa  669  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  75.29 
 
 
430 aa  668  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  75.12 
 
 
429 aa  672  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  75.12 
 
 
533 aa  675  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  74.59 
 
 
430 aa  654  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  69.63 
 
 
429 aa  628  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  70.47 
 
 
430 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  68.37 
 
 
430 aa  619  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  69.07 
 
 
430 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  68.84 
 
 
430 aa  616  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  68.37 
 
 
429 aa  610  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  69.07 
 
 
429 aa  605  1e-172  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  68.14 
 
 
429 aa  601  1e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  68.21 
 
 
431 aa  602  1e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  67.91 
 
 
429 aa  600  1e-170  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  68.14 
 
 
429 aa  597  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  66.36 
 
 
437 aa  595  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  67.52 
 
 
431 aa  595  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  68.3 
 
 
428 aa  582  1e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  70 
 
 
429 aa  583  1e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  66.74 
 
 
429 aa  566  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  55.87 
 
 
425 aa  511  1e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 
430 aa  488  1e-137  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 
431 aa  490  1e-137  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  59.44 
 
 
432 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  59.21 
 
 
429 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  58.97 
 
 
429 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  54.88 
 
 
442 aa  470  1e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.40547e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  58.51 
 
 
432 aa  469  1e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  58.51 
 
 
453 aa  469  1e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  58.51 
 
 
432 aa  470  1e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  56.21 
 
 
431 aa  466  1e-130  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  54.67 
 
 
432 aa  465  1e-130  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  58.74 
 
 
432 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  51.37 
 
 
446 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  51.49 
 
 
446 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  54.86 
 
 
436 aa  455  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 
432 aa  452  1e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.34883e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  53.02 
 
 
431 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.77348e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  52.89 
 
 
435 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 
431 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.82785e-07  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 
431 aa  446  1e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 
431 aa  446  1e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  51.74 
 
 
433 aa  446  1e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 
432 aa  447  1e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.206e-11 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  52.64 
 
 
438 aa  446  1e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  51.95 
 
 
438 aa  445  1e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 
431 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 
430 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 
430 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 
431 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.97035e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  52.52 
 
 
440 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  2.27018e-07 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 
431 aa  440  1e-122  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.76094e-06  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 
431 aa  441  1e-122  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 
431 aa  439  1e-122  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 
430 aa  440  1e-122  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 
431 aa  438  1e-122  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 
431 aa  439  1e-122  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.10825e-05  hitchhiker  1.53755e-05 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 
444 aa  441  1e-122  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 
427 aa  440  1e-122  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 
430 aa  440  1e-122  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 
431 aa  439  1e-122  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 
431 aa  439  1e-122  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  3.17238e-05  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
431 aa  438  1e-122  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
430 aa  438  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 
431 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  4.71969e-05 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 
432 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 
429 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 
430 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 
431 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  51.95 
 
 
437 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 
431 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  7.09559e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 
432 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
431 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 
431 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  51.05 
 
 
432 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 
430 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 
431 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 
432 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  4.72279e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 
431 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.03533e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>