186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0836 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0836  porin  100 
 
 		 254 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  78.74 
 
 		 243 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  63.98 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3546  porin  61.8 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  49.81 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  49.24 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  43.84 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  46.48 
 
 		 276 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  45.86 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  49.03 
 
 		 278 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  49.41 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  45.45 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  44.74 
 
 		 288 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  42.31 
 
 		 302 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  43.02 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  41.37 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  44.89 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  44.89 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  44.72 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  44.72 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  44.96 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  44.6 
 
 		 290 aa  138  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  44.6 
 
 		 290 aa  138  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  42.91 
 
 		 296 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  38.89 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  39.07 
 
 		 299 aa  131  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  41.95 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  43.82 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  38.38 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  40.71 
 
 		 571 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  36.16 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  43.82 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  43.82 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  40.68 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  41.2 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  40.68 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  42.09 
 
 		 294 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  40.73 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  39.43 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  39.26 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  37.75 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  39.37 
 
 		 583 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  39.52 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  41.08 
 
 		 452 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  34.5 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  42.13 
 
 		 207 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  36.71 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  38.66 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  38.08 
 
 		 453 aa  112  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  37.34 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  35.79 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  38.24 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  35 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  35.09 
 
 		 285 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  36.98 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  34.63 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  36.26 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  36.18 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  33.83 
 
 		 283 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  41.26 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  36.92 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  32.41 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  32.41 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  37.32 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  35.56 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  35.77 
 
 		 577 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  37.96 
 
 		 449 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  35.86 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  34 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  32.58 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  35.65 
 
 		 454 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.78 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  34.7 
 
 		 449 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  35.37 
 
 		 206 aa  91.7  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  37.57 
 
 		 661 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  40.22 
 
 		 447 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  36.67 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  33.59 
 
 		 693 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  36.21 
 
 		 207 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.35 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  38.2 
 
 		 689 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  34.78 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  33.33 
 
 		 997 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  34.72 
 
 		 284 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  31.19 
 
 		 228 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  35.02 
 
 		 692 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  37.44 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  35.58 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  39.66 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  32.43 
 
 		 570 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.06 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  37.2 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  32.17 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  31.84 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32.84 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  34.63 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.77 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  29.95 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  29.95 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  36.32 
 
 		 566 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>