More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0796 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
339 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  90.94 
 
 
347 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  93.1 
 
 
333 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  70.81 
 
 
317 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  48.94 
 
 
304 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  43.54 
 
 
307 aa  202  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  42.34 
 
 
292 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  41.67 
 
 
292 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38 
 
 
325 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  42.18 
 
 
292 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  37.37 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.22 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  38.54 
 
 
310 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  36.61 
 
 
315 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  39.08 
 
 
317 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  39.86 
 
 
292 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  39.86 
 
 
292 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  40.15 
 
 
311 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  35.57 
 
 
301 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  39.86 
 
 
311 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  37.76 
 
 
295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  38.97 
 
 
292 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  34.94 
 
 
310 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.8 
 
 
314 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  36.52 
 
 
300 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  36.43 
 
 
294 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  38.71 
 
 
320 aa  149  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  35.74 
 
 
295 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  36.13 
 
 
301 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  37.82 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  33.79 
 
 
295 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  34.56 
 
 
316 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  32.78 
 
 
331 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.95 
 
 
295 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  34.25 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  38.15 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  40.79 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  40.43 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  35.21 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  36.06 
 
 
308 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  34.92 
 
 
293 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  33.58 
 
 
289 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  34.88 
 
 
299 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  30.07 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  35.97 
 
 
310 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  33.8 
 
 
294 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  33.8 
 
 
294 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  33.58 
 
 
303 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  35.23 
 
 
289 aa  119  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  30.69 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  35.21 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.21 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  30.45 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.5 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  32.32 
 
 
309 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  30.45 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  35.11 
 
 
308 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  32.11 
 
 
307 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 
305 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  31.77 
 
 
307 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  31.6 
 
 
307 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  30.87 
 
 
317 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  36.16 
 
 
311 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  30.87 
 
 
317 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  32.99 
 
 
285 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  31.67 
 
 
319 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.76 
 
 
289 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  30.24 
 
 
313 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
293 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.83 
 
 
293 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.47 
 
 
305 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  30.91 
 
 
317 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
305 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.16 
 
 
322 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  32.07 
 
 
312 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  36.61 
 
 
311 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  30.28 
 
 
312 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  31.25 
 
 
293 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3630  hypothetical protein  31.38 
 
 
309 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  34.18 
 
 
306 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  35.02 
 
 
317 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.27 
 
 
291 aa  100  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  33.8 
 
 
309 aa  99.4  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  33.22 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  30.26 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  31.82 
 
 
338 aa  97.4  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  30.26 
 
 
333 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  33.99 
 
 
307 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.02 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  32.27 
 
 
319 aa  97.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  29.64 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  35.56 
 
 
313 aa  96.7  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 
298 aa  96.3  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  33 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  30.27 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  33.19 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  30.39 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>