More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0769 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  81.86 
 
 
725 aa  1096    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  54.23 
 
 
742 aa  656    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
732 aa  1437    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  80.9 
 
 
725 aa  1088    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  53.28 
 
 
742 aa  669    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  53.42 
 
 
742 aa  658    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 
1486 aa  334  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 
1152 aa  327  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
1152 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
1067 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
733 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
765 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
1275 aa  303  8.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
632 aa  300  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
958 aa  298  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
746 aa  297  4e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 
625 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 
625 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  33.29 
 
 
734 aa  293  9e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
723 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
1334 aa  289  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
709 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
709 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 
625 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  35.66 
 
 
988 aa  286  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  34.7 
 
 
857 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
1509 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
721 aa  277  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
996 aa  277  7e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.82 
 
 
1561 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  35.12 
 
 
1182 aa  270  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  33.89 
 
 
717 aa  270  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  34.6 
 
 
710 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
832 aa  269  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  26.44 
 
 
731 aa  266  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
983 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
1991 aa  264  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
775 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
717 aa  259  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 
728 aa  256  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  35.89 
 
 
1644 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  35.89 
 
 
1644 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
790 aa  250  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
658 aa  249  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 
880 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
602 aa  238  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  30.8 
 
 
2046 aa  233  7.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 
794 aa  233  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  26.56 
 
 
783 aa  229  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.26 
 
 
610 aa  226  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
684 aa  224  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 
617 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1084 aa  220  6e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
684 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  35.28 
 
 
653 aa  211  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  28.36 
 
 
810 aa  208  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 
652 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  37.22 
 
 
635 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  36.85 
 
 
531 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  33.51 
 
 
670 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.26 
 
 
809 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
555 aa  191  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
556 aa  191  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
808 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
539 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
1297 aa  187  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  34.61 
 
 
662 aa  187  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
1359 aa  187  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
1213 aa  183  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
1759 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  36.62 
 
 
551 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
586 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 
551 aa  178  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
958 aa  171  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
796 aa  170  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
729 aa  158  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
748 aa  157  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
510 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  29.91 
 
 
1694 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  30.23 
 
 
632 aa  152  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
1188 aa  150  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
1162 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
1193 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
1386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
1198 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
974 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
783 aa  132  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  32.88 
 
 
1165 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  32.88 
 
 
1165 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
1191 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 
525 aa  127  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  31.03 
 
 
1003 aa  127  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
1192 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4710  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 
749 aa  127  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.436323  normal  0.224848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  25.05 
 
 
872 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
1190 aa  125  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  32.3 
 
 
2401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1974  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 
853 aa  121  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>