More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0677 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  89.28 
 
 		 830 aa  1333    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  58.94 
 
 		 796 aa  752    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 815 aa  1601    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  69.97 
 
 		 814 aa  951    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  88.55 
 
 		 830 aa  1325    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  58.62 
 
 		 810 aa  725    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  44.19 
 
 		 750 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  46.27 
 
 		 775 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  46.71 
 
 		 714 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  45.45 
 
 		 727 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  44.12 
 
 		 720 aa  467  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  44.32 
 
 		 728 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  45.78 
 
 		 734 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  45.36 
 
 		 727 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  45.55 
 
 		 763 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  46.32 
 
 		 720 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  43.65 
 
 		 739 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  45.76 
 
 		 714 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  44.26 
 
 		 712 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  44.78 
 
 		 728 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  43.99 
 
 		 741 aa  456  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  44.13 
 
 		 732 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  47.03 
 
 		 626 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  44.02 
 
 		 734 aa  450  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  45.25 
 
 		 735 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  47.58 
 
 		 757 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  46.07 
 
 		 658 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  42.66 
 
 		 691 aa  442  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  41.82 
 
 		 833 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  42 
 
 		 779 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  42.29 
 
 		 770 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  43.45 
 
 		 776 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  41.05 
 
 		 768 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  43.57 
 
 		 750 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  43.4 
 
 		 727 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  45.92 
 
 		 626 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  42.52 
 
 		 723 aa  412  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  42.39 
 
 		 763 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  42.39 
 
 		 730 aa  405  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  42.97 
 
 		 699 aa  405  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  43.74 
 
 		 656 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  40.88 
 
 		 669 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  42.54 
 
 		 732 aa  398  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  38.63 
 
 		 759 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  41.54 
 
 		 654 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  41.03 
 
 		 712 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  40.8 
 
 		 709 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  40.06 
 
 		 712 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  39.04 
 
 		 718 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  39.71 
 
 		 784 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  39.71 
 
 		 765 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  39.61 
 
 		 760 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  41.95 
 
 		 651 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  39.5 
 
 		 759 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  39.16 
 
 		 742 aa  382  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  40.92 
 
 		 744 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  39.42 
 
 		 769 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  39.1 
 
 		 757 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  39.42 
 
 		 750 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  38.74 
 
 		 724 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  37.56 
 
 		 758 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  39.31 
 
 		 760 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  38.29 
 
 		 718 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  37.69 
 
 		 831 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  40.35 
 
 		 764 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  37.8 
 
 		 788 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  38.02 
 
 		 776 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  37.74 
 
 		 707 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  38.07 
 
 		 724 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.99 
 
 		 648 aa  362  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  41.68 
 
 		 712 aa  362  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  38.67 
 
 		 755 aa  360  5e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  37.08 
 
 		 788 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  38.12 
 
 		 729 aa  355  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  37.89 
 
 		 811 aa  355  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  39.86 
 
 		 743 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  37.44 
 
 		 714 aa  351  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  40 
 
 		 824 aa  351  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  39.81 
 
 		 824 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  39.1 
 
 		 735 aa  349  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  39.86 
 
 		 733 aa  343  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  40 
 
 		 618 aa  341  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.46 
 
 		 727 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  36.9 
 
 		 728 aa  340  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  35.33 
 
 		 626 aa  339  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  38.12 
 
 		 680 aa  338  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  36.63 
 
 		 736 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  39.15 
 
 		 692 aa  332  1e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.87 
 
 		 643 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.87 
 
 		 643 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  39.06 
 
 		 661 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  40.78 
 
 		 658 aa  330  9e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  35.11 
 
 		 683 aa  327  6e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  38.67 
 
 		 776 aa  325  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  35.57 
 
 		 681 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  37.84 
 
 		 761 aa  323  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  34.17 
 
 		 795 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  36.02 
 
 		 655 aa  319  1e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  40.8 
 
 		 761 aa  317  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  40.55 
 
 		 625 aa  317  6e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>