97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0298 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 257 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  90.2 
 
 		 255 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  89.8 
 
 		 255 aa  411  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  51.37 
 
 		 265 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  53.01 
 
 		 271 aa  234  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  40.8 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  40.8 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  38.96 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  36.22 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  39.53 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  38.32 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.56 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  34.88 
 
 		 271 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  33.57 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  32.14 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  36.71 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  40.52 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  37.5 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  34.88 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  32.57 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  33.47 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  30.23 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  29.34 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  32.67 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  28.57 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  34.57 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000249253 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.34 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2982  hypothetical protein  32.82 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  26.14 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1667  putative transmembrane anti-sigma factor  32.44 
 
 		 283 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2555  putative transmembrane anti-sigma factor  32.17 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  28.74 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2783  putative transmembrane transcriptional regulator(anti-sigma factor) protein, PrtR  37.31 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.77 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1253  putative transmembrane anti-sigma factor  30.8 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0479785  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  26.46 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  32.49 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3377  putative transmembrane anti-sigma factor  31.75 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  32.51 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  35.18 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  31.91 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  31.91 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  31.49 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3398  putative transmembrane anti-sigma factor  28 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.745464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  30.2 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  33 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2523  putative transmembrane anti-sigma factor  27.89 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.690899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3944  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.9 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00740335  normal  0.0369582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  31.58 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  35.64 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  35.64 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  35.64 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  30.45 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  34.04 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  34.98 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  34.98 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  36 
 
 		 495 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  35.27 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  36 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2893  putative transmembrane anti-sigma factor  32.08 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  35.2 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  35.2 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  35.2 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  35.2 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1386  hypothetical protein  38.74 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0048642  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3067  putative transmembrane anti-sigma factor  27.57 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0599961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2533  putative transmembrane anti-sigma factor  36.67 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420248  normal  0.0303873 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0728  putative transmembrane anti-sigma factor  35.02 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1105  putative transmembrane anti-sigma factor  27.47 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3001  putative transmembrane anti-sigma factor  31.25 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  27.59 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3785  putative transmembrane anti-sigma factor  30.43 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0373  putative transmembrane anti-sigma factor  39.47 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  38.14 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1369  putative transmembrane anti-sigma factor  38.64 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2803  putative transmembrane anti-sigma factor  27.14 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0342001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  37.7 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1375  hypothetical protein  37.31 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1649  putative transmembrane anti-sigma factor  37.88 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0261743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  26.14 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  28.96 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  47.44 
 
 		 307 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  28.85 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02866  transmembrane regulator protein PrtR  31.3 
 
 		 167 aa  49.3  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.822943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  26.57 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3821  putative transmembrane anti-sigma factor  28.35 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  31.78 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1789  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  27.7 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  31.78 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  26.79 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  30 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3094  putative transmembrane anti-sigma factor  27.97 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.334579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  28.93 
 
 		 322 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  25.74 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  25.95 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>