More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0094 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 929 aa  1861    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  59.75 
 
 		 1191 aa  830    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 582 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 		 829 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  33.12 
 
 		 872 aa  336  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  45.92 
 
 		 956 aa  331  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.04 
 
 		 998 aa  324  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 358 aa  255  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 897 aa  240  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0118  HWE histidine kinase  43.64 
 
 		 538 aa  237  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 		 942 aa  234  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 1001 aa  229  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  68.67 
 
 		 1224 aa  226  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  54.88 
 
 		 930 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  54.88 
 
 		 930 aa  222  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 1002 aa  221  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 1016 aa  222  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  35.63 
 
 		 1041 aa  220  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 759 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 725 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  53.55 
 
 		 934 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  44.41 
 
 		 827 aa  211  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5220  putative GAF sensor protein  66.87 
 
 		 182 aa  211  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.583285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 586 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 409 aa  207  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 662 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 372 aa  195  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 512 aa  194  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 635 aa  193  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  58.49 
 
 		 500 aa  191  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 601 aa  190  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  57.86 
 
 		 500 aa  188  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  66.67 
 
 		 864 aa  187  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  32.04 
 
 		 583 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 850 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 713 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 583 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 943 aa  183  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 341 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 583 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 571 aa  178  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  55.21 
 
 		 512 aa  177  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 380 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  36.2 
 
 		 728 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 840 aa  174  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 728 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 713 aa  174  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  37.39 
 
 		 717 aa  173  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  48.77 
 
 		 251 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 999 aa  173  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 503 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 		 413 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.64 
 
 		 1202 aa  172  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 488 aa  172  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.5 
 
 		 1785 aa  172  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 602 aa  171  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 635 aa  171  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 717 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 352 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 603 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 		 733 aa  168  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 416 aa  168  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 489 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 349 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  49.38 
 
 		 722 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 338 aa  165  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  53.33 
 
 		 390 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  52.29 
 
 		 506 aa  164  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 258 aa  164  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  50.94 
 
 		 401 aa  164  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  47 
 
 		 946 aa  163  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  46.51 
 
 		 542 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 		 304 aa  163  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  49.51 
 
 		 901 aa  163  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 		 1965 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  50.98 
 
 		 226 aa  161  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  54.55 
 
 		 389 aa  160  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 867 aa  160  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  49.11 
 
 		 728 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.97 
 
 		 837 aa  159  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 681 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  49.36 
 
 		 732 aa  159  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 907 aa  159  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 339 aa  157  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  47.8 
 
 		 677 aa  157  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 738 aa  157  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.66 
 
 		 1423 aa  156  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 488 aa  156  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50.33 
 
 		 321 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.12 
 
 		 1550 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1700  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.44 
 
 		 767 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 488 aa  155  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  42.44 
 
 		 488 aa  155  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2182  signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 528 aa  154  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  52.56 
 
 		 398 aa  154  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 489 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4311  signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 365 aa  153  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.801495  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  27.86 
 
 		 624 aa  153  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 465 aa  154  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  41.83 
 
 		 261 aa  152  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>