30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0088 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  100 
 
 		 245 aa  480  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  69.06 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  42.77 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  35.37 
 
 		 584 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  37.78 
 
 		 325 aa  111  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  35.03 
 
 		 942 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  38.73 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  32.87 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  31.48 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  35.25 
 
 		 316 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  31.82 
 
 		 327 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  36.99 
 
 		 383 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  34.07 
 
 		 135 aa  92  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  33.78 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  29.14 
 
 		 851 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  35.34 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  29.59 
 
 		 585 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  22.07 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  30.77 
 
 		 552 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  30.77 
 
 		 552 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  28.83 
 
 		 1048 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  32.39 
 
 		 195 aa  48.5  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  26.36 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 		 1348 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  27.13 
 
 		 1656 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  33.33 
 
 		 880 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  33.33 
 
 		 880 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  29.41 
 
 		 598 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  28.57 
 
 		 796 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  30.61 
 
 		 1363 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>