39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0068 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0068  metallophosphoesterase  100 
 
 
125 aa  258  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.494721 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5667  metallophosphoesterase  57.46 
 
 
181 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2507  metallophosphoesterase  55 
 
 
190 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5193  metallophosphoesterase  54.03 
 
 
194 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.347641  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3411  metallophosphoesterase  58.73 
 
 
185 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1365  metallophosphoesterase  56.35 
 
 
185 aa  120  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3216  metallophosphoesterase  57.94 
 
 
185 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3540  metallophosphoesterase  53.97 
 
 
185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.81535  normal  0.605156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1558  metallophosphoesterase  51.59 
 
 
184 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0614  metallophosphoesterase  50.79 
 
 
198 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20629  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1922  metallophosphoesterase  49.19 
 
 
183 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.611638  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5395  metallophosphoesterase  47.58 
 
 
169 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0898  metallophosphoesterase  46.34 
 
 
171 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0982  metallophosphoesterase  44.72 
 
 
167 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0235375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1897  metallophosphoesterase  44.26 
 
 
189 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1615  metallophosphoesterase  44.26 
 
 
189 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  hitchhiker  0.00320974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1621  metallophosphoesterase  44.26 
 
 
208 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1345  metallophosphoesterase  44.72 
 
 
173 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3723  metallophosphoesterase  43.8 
 
 
178 aa  94  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30333  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4140  hypothetical protein  37.6 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1372  phosphoesterase or phosphohydrolase-like  37.3 
 
 
268 aa  77.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25500  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  36.72 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20440  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  36.36 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.5474  normal  0.257186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0016  metallophosphoesterase  31.71 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05520  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  35.54 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3176  metallophosphoesterase  38.55 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.398414  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0561  phosphoesterase or phosphohydrolase-like protein  38.64 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1552  hypothetical protein  32.77 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000398029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1871  metallophosphoesterase  26.19 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000170547  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1212  metallophosphoesterase  32.14 
 
 
493 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1598  metallophosphoesterase  43.75 
 
 
204 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0613  phosphoesterase or phosphohydrolase  30.77 
 
 
285 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2517  metallophosphoesterase  29.2 
 
 
424 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0368  metallophosphoesterase  36.05 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.116618  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0784  phosphoesterase or phosphohydrolase  34.83 
 
 
204 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0663  phosphoesterase/phosphohydrolase  33.33 
 
 
273 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0765  metallophosphoesterase  26.77 
 
 
172 aa  48.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4371  metallophosphoesterase  34.94 
 
 
196 aa  47.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1434  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
243 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.135819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>