237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0059 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  100 
 
 
331 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  88.31 
 
 
331 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  85.93 
 
 
331 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  62.31 
 
 
323 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  60.19 
 
 
342 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  58.49 
 
 
341 aa  349  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  58.54 
 
 
332 aa  348  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  57.81 
 
 
327 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  57.59 
 
 
328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  57.37 
 
 
328 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  58.77 
 
 
328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  55.9 
 
 
327 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  52.42 
 
 
334 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  43.45 
 
 
325 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  43.27 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  36.92 
 
 
330 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  38.06 
 
 
326 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  37.46 
 
 
338 aa  193  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  37.97 
 
 
336 aa  193  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  37.42 
 
 
331 aa  192  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  34.07 
 
 
333 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  32 
 
 
331 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  35.78 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  30.46 
 
 
324 aa  169  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  31.58 
 
 
326 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  31.79 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  31.17 
 
 
327 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  30.25 
 
 
327 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  31.48 
 
 
323 aa  153  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  38.37 
 
 
479 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
486 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  37.6 
 
 
471 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  34.55 
 
 
481 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  34.29 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  30.66 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  30.17 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  33.77 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  31.11 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 
327 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2509  thiamine-monophosphate kinase  34.78 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0452713  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  33.63 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  30.15 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  30.1 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  27.97 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  33.2 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  32.3 
 
 
326 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.88 
 
 
781 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  26.5 
 
 
323 aa  59.3  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  28.72 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  30.8 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  34.59 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  35.95 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  25.4 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  34.05 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  34.48 
 
 
332 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  34.48 
 
 
332 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  36.51 
 
 
313 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  30.72 
 
 
319 aa  56.6  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  25.65 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.19 
 
 
764 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  34.43 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  34.05 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  24.84 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  27.1 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  33.94 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  32.34 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  27.81 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  31.85 
 
 
352 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  24.51 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  36.09 
 
 
358 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  31.58 
 
 
339 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 
314 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.85 
 
 
768 aa  53.9  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  27.72 
 
 
327 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  31.62 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  31.28 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  24.51 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  30.6 
 
 
361 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  32.05 
 
 
326 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  30.22 
 
 
361 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  26.07 
 
 
323 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  26.07 
 
 
323 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  31.94 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  24.51 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  28.47 
 
 
324 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  26.07 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  28.7 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  33.15 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  33.15 
 
 
351 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  25.19 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  35.04 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  26.13 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  26.58 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  33.87 
 
 
339 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  37.37 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.46 
 
 
716 aa  50.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.191388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  26.33 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  37.14 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  30.69 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>