20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0055 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0055  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  332  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.899149  normal  0.0738281 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5392  hypothetical protein  99.38 
 
 
160 aa  329  7.000000000000001e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.692914  normal  0.894504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0244  hypothetical protein  98.75 
 
 
160 aa  328  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1407  hypothetical protein  82.5 
 
 
160 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41965  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2716  hypothetical protein  81.88 
 
 
160 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4560  hypothetical protein  83.12 
 
 
160 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.909348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3479  hypothetical protein  79.38 
 
 
160 aa  270  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.854167  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2105  hypothetical protein  79.38 
 
 
160 aa  268  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.310588 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2618  hypothetical protein  76.25 
 
 
160 aa  259  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7575  hypothetical protein  73.75 
 
 
160 aa  257  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.690895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4752  hypothetical protein  74.38 
 
 
160 aa  255  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0139717  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0840  hypothetical protein  73.75 
 
 
160 aa  254  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.532109  normal  0.0632137 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1107  hypothetical protein  73.75 
 
 
160 aa  254  4e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.217641 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13121  hypothetical protein  73.12 
 
 
160 aa  253  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0562  hypothetical protein  79.38 
 
 
160 aa  251  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1991  hypothetical protein  74.38 
 
 
160 aa  241  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4694  hypothetical protein  46.1 
 
 
174 aa  127  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6660  hypothetical protein  44.68 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00729758  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2061  hypothetical protein  46.1 
 
 
185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1225  hypothetical protein  45.39 
 
 
173 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.551867  normal  0.397469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>