39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0045 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0045  malonate transporter, MadL subunit  100 
 
 		 151 aa  290  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0451668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6858  malonate transporter, MadL subunit  84.62 
 
 		 148 aa  229  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3150  malonate transporter, MadL subunit  83.92 
 
 		 148 aa  229  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3194  malonate transporter, MadL subunit  65.99 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4285  malonate transporter MadL subunit  68.91 
 
 		 140 aa  160  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0889928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0449  malonate transporter MadL subunit  60.83 
 
 		 138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5295  malonate transporter MadL subunit  54.01 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127273  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5080  malonate transporter, MadL subunit  59.17 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2445  malonate transporter, MadL subunit  61.4 
 
 		 140 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4944  malonate transporter, MadL subunit  55.56 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0481665 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3868  malonate transporter, MadL subunit  55.56 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10350  malonate transporter, MadL subunit  55.3 
 
 		 141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.784463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2876  malonate transporter, MadL subunit  54.96 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452237  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5376  malonate transporter, MadL subunit  61.86 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0540357  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0954  malonate transporter MadL subunit  52.76 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02630  putative malonate carrier protein  53.79 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0299  malonate transporter subunit MadL  58.33 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1579  malonate transporter, L subunit  56.9 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1449  malonate transporter, MadL subunit  56.9 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3039  malonate transporter, L subunit  56.03 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0536  malonate transporter, MadL subunit  56.03 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.625704  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0617  malonate transporter, MadL subunit  56.03 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1253  malonate transporter, MadL subunit  56.03 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1479  malonate transporter, MadL subunit  56.03 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1329  transporter  45.74 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1145  malonate transporter MadL subunit  60.34 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1552  malonate transporter, MadL subunit  46.34 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0430207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1239  malonate transporter, MadL subunit  60.34 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451003  normal  0.163591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0786  malonate transporter MadL subunit  60.34 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1267  malonate transporter MadL subunit  60.34 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2052  malonate transporter, MadL subunit  60.34 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2805  malonate transporter, L subunit  57.76 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330153  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1157  malonate transporter, MadL subunit  60.34 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775412  normal  0.145161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6323  malonate transporter, MadL subunit  52.85 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1611  malonate transporter MadL subunit  64.21 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1064  transporter  40.28 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3291  hypothetical protein  42.75 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4410  malonate/sodium symporter MadL subunit  60.34 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.433384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1148  malonate/sodium symporter, MadL subunit  52.99 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0497495  normal  0.756972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>