More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0042 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 332 aa  657    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15937  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.73 
 
 		 333 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  89.12 
 
 		 332 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.939722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  89.12 
 
 		 332 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.867274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.1 
 
 		 337 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.88 
 
 		 333 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.55 
 
 		 332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.87 
 
 		 332 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6955  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.9 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.06 
 
 		 336 aa  345  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.54 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.06 
 
 		 336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.61 
 
 		 336 aa  332  7.000000000000001e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.71 
 
 		 334 aa  322  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.38 
 
 		 355 aa  292  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  51.77 
 
 		 342 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  51.77 
 
 		 342 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  51.77 
 
 		 342 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  51.45 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 		 369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  50.48 
 
 		 342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  50.48 
 
 		 342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  48.48 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  51.45 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  51.45 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  51.45 
 
 		 343 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  51.13 
 
 		 343 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2259  short chain dehydrogenase  51.13 
 
 		 343 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1975  short chain dehydrogenase  51.13 
 
 		 343 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509548  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0996  short chain dehydrogenase  51.13 
 
 		 343 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.663659  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  47.74 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  38.99 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.67 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.317151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 295 aa  183  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5503  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148603  normal  0.0783647 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0472  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 		 327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  35.06 
 
 		 544 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6285  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 327 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306501  hitchhiker  0.00902289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7903  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.943386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2751  short chain dehydrogenase  36.57 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3105  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0188574  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6571  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4439  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 		 336 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 		 442 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 441 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3688  short chain dehydrogenase  34.32 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000592094  normal  0.0665627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  36.48 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  0.848233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4176  short chain dehydrogenase  35.95 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2660  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0273  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.698832 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0291  short chain dehydrogenase  33.74 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0343  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2751  short chain dehydrogenase  34.08 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 261 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1984  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 346 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 		 327 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.155231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 350 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2357  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.486705  decreased coverage  0.000279789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2310  short chain dehydrogenase  35.4 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.604961  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2083  short chain dehydrogenase  32.85 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244735  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.51 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5733  short chain dehydrogenase  31.55 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3554  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1077  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 337 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 		 272 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1184  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  33.84 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>