More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0039 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  66.8 
 
 
504 aa  653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 
505 aa  1000    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  64.71 
 
 
505 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  88.19 
 
 
520 aa  880    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  66.39 
 
 
497 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  82.16 
 
 
506 aa  819    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  87.99 
 
 
520 aa  879    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  85.51 
 
 
507 aa  837    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  58.4 
 
 
508 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  56.6 
 
 
502 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  57.94 
 
 
501 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  56.26 
 
 
504 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  56.46 
 
 
501 aa  538  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  56.3 
 
 
502 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  54.26 
 
 
532 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  54.71 
 
 
498 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  52.59 
 
 
500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  53.54 
 
 
494 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  54.7 
 
 
496 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  52.97 
 
 
494 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  56.07 
 
 
489 aa  508  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  54.18 
 
 
503 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  51.15 
 
 
505 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  52.1 
 
 
498 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  52.93 
 
 
503 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  51.26 
 
 
496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  50.21 
 
 
497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  47.29 
 
 
494 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.73 
 
 
480 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  42.67 
 
 
480 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  40.86 
 
 
481 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  37.45 
 
 
482 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  37.95 
 
 
499 aa  310  5e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  38.12 
 
 
535 aa  309  9e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  37.18 
 
 
483 aa  290  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  36.88 
 
 
478 aa  286  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  33.82 
 
 
492 aa  272  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  33.61 
 
 
492 aa  259  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  35.17 
 
 
489 aa  259  6e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  33.68 
 
 
482 aa  249  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  33.33 
 
 
492 aa  233  8.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  26.77 
 
 
506 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  31.01 
 
 
518 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  27.33 
 
 
510 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  26.73 
 
 
507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  26.73 
 
 
507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  27.33 
 
 
510 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  27.29 
 
 
514 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  30.36 
 
 
491 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  31.35 
 
 
575 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  27.13 
 
 
512 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  30.77 
 
 
481 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  26.88 
 
 
512 aa  156  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4017  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.35 
 
 
491 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546145  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  30.99 
 
 
575 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  30.99 
 
 
575 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  26.68 
 
 
512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  26.34 
 
 
509 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  26.37 
 
 
509 aa  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  26.17 
 
 
498 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  26.99 
 
 
528 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  26.48 
 
 
500 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  27.48 
 
 
504 aa  151  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  31.87 
 
 
494 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  26.17 
 
 
509 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  26.28 
 
 
500 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  26.07 
 
 
488 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  25.49 
 
 
519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  26.81 
 
 
497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  30.52 
 
 
562 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  30.93 
 
 
562 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3549  non-specific serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 
481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  26.24 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3834  non-specific serine/threonine protein kinase  30 
 
 
481 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  30.86 
 
 
567 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  28.4 
 
 
574 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1936  non-specific serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 
481 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282064  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  25.71 
 
 
509 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  26.17 
 
 
521 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  26.17 
 
 
521 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  25.96 
 
 
520 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  25.41 
 
 
519 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  25.2 
 
 
519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  25.5 
 
 
514 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  28.45 
 
 
565 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  24.95 
 
 
459 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  27.1 
 
 
573 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  28.81 
 
 
563 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  28.18 
 
 
584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  29.46 
 
 
570 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  29.46 
 
 
570 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  27.96 
 
 
560 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 
463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4783  putative circadian clock protein, KaiC  30.19 
 
 
479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.825457 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  29.59 
 
 
484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  27.37 
 
 
569 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  26.64 
 
 
559 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  25.32 
 
 
574 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.95 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  24.41 
 
 
454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>