73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0019 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  93.83 
 
 
456 aa  862    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  81.64 
 
 
452 aa  755    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 
461 aa  919    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  93.61 
 
 
456 aa  862    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  68.07 
 
 
454 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  69.03 
 
 
451 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4186  polysulphide reductase, NrfD  63.19 
 
 
456 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317108  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  49.88 
 
 
454 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  48.74 
 
 
466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  46.86 
 
 
463 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  45.43 
 
 
468 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  46.84 
 
 
451 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  46.1 
 
 
476 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  46.28 
 
 
471 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3385  Polysulphide reductase NrfD  44.94 
 
 
486 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  48.19 
 
 
472 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  44.14 
 
 
466 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  45.95 
 
 
478 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  45.95 
 
 
478 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  46.43 
 
 
478 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  43.22 
 
 
593 aa  364  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  45.25 
 
 
482 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  44.27 
 
 
478 aa  360  4e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  40.6 
 
 
494 aa  356  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  42.38 
 
 
445 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  41.67 
 
 
490 aa  355  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  41.7 
 
 
476 aa  352  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  43.09 
 
 
451 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  43.75 
 
 
484 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  41.83 
 
 
477 aa  339  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  43.95 
 
 
603 aa  338  8e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  45.81 
 
 
448 aa  336  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  39.91 
 
 
493 aa  326  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  41.08 
 
 
472 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  40.65 
 
 
456 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  43.83 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  39.69 
 
 
624 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  39.12 
 
 
624 aa  292  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  39.95 
 
 
448 aa  262  8e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  37.31 
 
 
674 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4973  hypothetical protein  27.78 
 
 
666 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  22.83 
 
 
448 aa  83.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4459  hypothetical protein  29.19 
 
 
642 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  24.49 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  23.1 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4923  hypothetical protein  27.95 
 
 
642 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116245  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  23.43 
 
 
453 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  21.58 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  23.55 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  20.98 
 
 
383 aa  63.2  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  24.02 
 
 
414 aa  60.1  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  21.35 
 
 
383 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  21.17 
 
 
385 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  22.79 
 
 
469 aa  56.6  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  20.66 
 
 
383 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  20.5 
 
 
389 aa  54.3  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  24.13 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  20.65 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  23.1 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  21.35 
 
 
385 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  26.32 
 
 
442 aa  50.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  21.6 
 
 
435 aa  50.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  19.93 
 
 
385 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  21.91 
 
 
389 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  22.12 
 
 
416 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  22.49 
 
 
411 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  20.71 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  22.75 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  22.07 
 
 
384 aa  44.3  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  22.5 
 
 
417 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  25.47 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  25.96 
 
 
417 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>