199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0614 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  100 
 
 
640 aa  1268    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  50.25 
 
 
424 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  51.26 
 
 
420 aa  391  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  43.2 
 
 
548 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  46.85 
 
 
476 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  46.85 
 
 
476 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  46.85 
 
 
476 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  46.85 
 
 
476 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  46.85 
 
 
476 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  46.08 
 
 
475 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  46.08 
 
 
475 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  46.08 
 
 
475 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  46.08 
 
 
475 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1623  putative alpha helix chain  49.03 
 
 
462 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.577151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  46.33 
 
 
475 aa  369  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  46.08 
 
 
475 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  46.08 
 
 
475 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  46.33 
 
 
475 aa  369  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  45.22 
 
 
485 aa  369  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  46.08 
 
 
475 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  46.96 
 
 
522 aa  362  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  48.37 
 
 
520 aa  361  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  46.02 
 
 
518 aa  360  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  47.09 
 
 
498 aa  360  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  42.32 
 
 
518 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  47.7 
 
 
515 aa  358  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  49.48 
 
 
492 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  49.74 
 
 
492 aa  353  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  45.65 
 
 
513 aa  352  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  47.4 
 
 
518 aa  351  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  45.24 
 
 
501 aa  351  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  45.6 
 
 
491 aa  350  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  47.32 
 
 
507 aa  349  7e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  48.73 
 
 
495 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  48.98 
 
 
495 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  48.98 
 
 
495 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  48.73 
 
 
495 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  46.47 
 
 
501 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  46.47 
 
 
501 aa  348  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  46.07 
 
 
498 aa  348  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  46.47 
 
 
501 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  48.16 
 
 
492 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  46.53 
 
 
519 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  46.53 
 
 
519 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  46.53 
 
 
519 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  47.28 
 
 
515 aa  347  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  46.53 
 
 
519 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  46.53 
 
 
518 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  46.82 
 
 
521 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  46.82 
 
 
521 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  46.82 
 
 
521 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  47.26 
 
 
537 aa  343  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  44.41 
 
 
429 aa  343  5.999999999999999e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  47.83 
 
 
510 aa  343  7e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  42.86 
 
 
513 aa  342  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  43.96 
 
 
510 aa  341  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  48.66 
 
 
448 aa  340  5e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  42.53 
 
 
457 aa  340  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  47.4 
 
 
500 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  49.71 
 
 
453 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  41.63 
 
 
506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  48.09 
 
 
491 aa  334  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  44.68 
 
 
520 aa  331  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  46.89 
 
 
491 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  45.65 
 
 
427 aa  327  3e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  42.89 
 
 
494 aa  328  3e-88  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  44.86 
 
 
407 aa  327  5e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  40.59 
 
 
480 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2890  hypothetical protein  47.16 
 
 
437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.18912  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  47.13 
 
 
453 aa  317  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  42.37 
 
 
527 aa  310  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  40.46 
 
 
470 aa  304  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0577  RmuC family protein  37.18 
 
 
397 aa  300  4e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.585058  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0447  hypothetical protein  38.52 
 
 
437 aa  300  5e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0432711  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  41.64 
 
 
494 aa  296  9e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2422  hypothetical protein  38.8 
 
 
639 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  33.05 
 
 
630 aa  270  7e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1053  hypothetical protein  36.83 
 
 
437 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  35.29 
 
 
535 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  37.87 
 
 
530 aa  266  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  35.67 
 
 
612 aa  266  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000597215  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1481  protein of unknown function DUF195  36.66 
 
 
435 aa  265  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0981784  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1370  protein of unknown function DUF195  36.18 
 
 
430 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  34.39 
 
 
510 aa  259  7e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0986  hypothetical protein  37.76 
 
 
403 aa  258  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0412766  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  38.44 
 
 
504 aa  258  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  37.13 
 
 
432 aa  253  6e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1094  hypothetical protein  35.84 
 
 
428 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437038  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  34.52 
 
 
626 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0125  RmuC domain-containing protein  37.69 
 
 
408 aa  234  3e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.63126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  36.44 
 
 
428 aa  223  9e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  31.62 
 
 
531 aa  199  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  32.53 
 
 
504 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  30.29 
 
 
459 aa  177  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1026  RmuC family protein  29.22 
 
 
435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000225596  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  33.16 
 
 
451 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  30.58 
 
 
448 aa  170  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  31.16 
 
 
512 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  30 
 
 
554 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  30.42 
 
 
525 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>