158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0416 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0416  nucleoid protein H-NS  100 
 
 
114 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0193878  hitchhiker  0.00866736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3165  putative HNS-like transcription regulator protein  48.21 
 
 
118 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2742  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.09 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  44.14 
 
 
102 aa  94.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5155  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.51 
 
 
97 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336859  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  42.34 
 
 
102 aa  90.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.28 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1598  nucleoid protein H-NS  38.18 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.28 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  39.29 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5080  Ler  34.21 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0343561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.79 
 
 
100 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  43.75 
 
 
100 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6772  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.58 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000111168  normal  0.0541472 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.94 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  38.95 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  40 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.27 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  39.58 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  39.58 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  39.58 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  39.58 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  39.58 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3943  H-NS histone family protein  39.58 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3109  H-NS histone family protein  39.58 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  37.89 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.15 
 
 
72 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386763  normal  0.64236 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.89 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.89 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.09 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.58 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3351  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.54 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.383074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  34.68 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1710  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443687  normal  0.618525 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.14 
 
 
121 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167387  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1558  H-NS histone family protein  37.37 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.752713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3189  H-NS histone family protein  38.54 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.63 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.74 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0231  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2858  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.259744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0249  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.14 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4220  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.27 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0162  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121985  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.02 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0175  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.02 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  32 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3984  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.09 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49889  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3154  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.73 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5214  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.73 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.73 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  35.42 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1968  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.67 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  35.42 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  35.42 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  35.42 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  35.42 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  35.42 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5767  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.76 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.68 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  34.38 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2442  H-NS histone family protein  35.35 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0742  H-NS histone family protein  35.35 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1174  H-NS histone family protein  35.35 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1706  H-NS histone family protein  35.35 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0365  H-NS histone family protein  34.38 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000040716  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.74 
 
 
113 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4071  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.68 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0737815 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0132  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.04 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.83 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.698098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0720  H-NS histone family protein  35.79 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4990  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.58 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0212879  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6596  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.69 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540075  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1247  H-NS histone family protein  35.79 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6005  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.63 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37 
 
 
191 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.47 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2981  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.84 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207499  decreased coverage  0.0000000417224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.87 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222409  normal  0.184824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4935  putative H-NS histon-like DNA-binding protein  31.96 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.529231  normal  0.833407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5335  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.91 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4746  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.91 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587516  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5527  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.91 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645148  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  31.91 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.9 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  31.73 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6929  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.69 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0088  DNA-binding protein BprA  31.91 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3224  DNA-binding protein BprA  31.91 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.67 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  30.85 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6619  putative HNS-like protein  32.98 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.890454 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7383  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.27 
 
 
254 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0126  H-NS histone family protein  30.85 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  30.85 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.65 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>