41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0277 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0277  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  847    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.294361  normal  0.0427595 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4481  DNA methylase N-4/N-6  51.15 
 
 
416 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5389  DNA methylase N-4/N-6  50.43 
 
 
355 aa  352  5e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.352939 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4984  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.54 
 
 
412 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.677083  normal  0.015231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3519  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.68 
 
 
331 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244279  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.14 
 
 
308 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3337  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.82 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149909  unclonable  0.0000000199825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1044  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.96 
 
 
330 aa  130  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0454  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.9 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.558336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3014  DNA methylase N-4/N-6  26.89 
 
 
301 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.718378  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.11 
 
 
313 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3185  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.85 
 
 
394 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4304  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.91 
 
 
874 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0407  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.09 
 
 
338 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0646308  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4803  DNA methylase  26.85 
 
 
322 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1221  modification methylase, putative  43.56 
 
 
204 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000763333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.1 
 
 
597 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.12 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.66 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.24 
 
 
292 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.53 
 
 
293 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.33 
 
 
276 aa  63.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.02 
 
 
274 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6265  hypothetical protein  41.1 
 
 
80 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
471 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.69 
 
 
308 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.69 
 
 
308 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  32 
 
 
447 aa  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6856  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.7 
 
 
313 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0555121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.75 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.35 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4634  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.96 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.67 
 
 
350 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  25 
 
 
304 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3323  DNA methylase  31.25 
 
 
542 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.622136  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.99 
 
 
313 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  40.32 
 
 
441 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  40 
 
 
307 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  32.14 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1355  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.5 
 
 
378 aa  43.9  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0685753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.3 
 
 
283 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>