194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0274 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0274  AAA family ATPase  100 
 
 
547 aa  1127    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0342467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1771  AAA ATPase central domain protein  39.96 
 
 
570 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6755  ATPase central domain-containing protein  44.06 
 
 
540 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4172  AAA ATPase, central region  40.84 
 
 
540 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18070  ATPase, AAA superfamily  39.51 
 
 
585 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0262  AAA family ATPase  43.01 
 
 
558 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.673428  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2338  ATPase central domain-containing protein  39.58 
 
 
571 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0047  ATPase central domain-containing protein  39.75 
 
 
608 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1499  ATPase, AAA family  42.67 
 
 
553 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.790722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1217  AAA ATPase central domain protein  42.76 
 
 
565 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000255374  hitchhiker  0.0000000181039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1175  ATPase central domain-containing protein  39.36 
 
 
574 aa  375  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700331  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1077  ATPase central domain-containing protein  38.54 
 
 
567 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0956592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2165  ATPase  40.46 
 
 
560 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4152  AAA ATPase central domain protein  36.78 
 
 
534 aa  286  5e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06718  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05752)  32.21 
 
 
822 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07091  hypothetical protein  38.14 
 
 
753 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01591  conserved hypothetical protein  41.18 
 
 
924 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181362  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08153  conserved hypothetical protein  31.78 
 
 
697 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677221 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03615  conserved hypothetical protein  36.59 
 
 
1049 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.391595  normal  0.0454206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  32.17 
 
 
725 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  31.21 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  32.7 
 
 
577 aa  71.6  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  33.99 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  30.45 
 
 
478 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
665 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  33.57 
 
 
448 aa  69.3  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  33.71 
 
 
772 aa  69.3  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  31.91 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  30.07 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  29.59 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  31.88 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  29.73 
 
 
678 aa  68.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  28.8 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  29.78 
 
 
744 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  31.91 
 
 
450 aa  67  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
656 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  31.79 
 
 
711 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  28.38 
 
 
646 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  32.9 
 
 
478 aa  66.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  33.58 
 
 
448 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  31.21 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  29.41 
 
 
619 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  29.76 
 
 
781 aa  64.3  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
749 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  29.78 
 
 
305 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  30.82 
 
 
656 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  32.57 
 
 
773 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  28.84 
 
 
578 aa  63.9  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  31.45 
 
 
653 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  32.62 
 
 
639 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  34.04 
 
 
773 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  27.86 
 
 
787 aa  62.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  31.91 
 
 
450 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  30.59 
 
 
771 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  27.85 
 
 
299 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  31.91 
 
 
657 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  30.34 
 
 
652 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  29.41 
 
 
459 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  27.08 
 
 
743 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  29.94 
 
 
725 aa  61.6  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  35.71 
 
 
753 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  31.74 
 
 
360 aa  61.2  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  32.85 
 
 
441 aa  60.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  29.81 
 
 
771 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  32.61 
 
 
766 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  31.13 
 
 
617 aa  60.8  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  31.74 
 
 
795 aa  60.5  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  28.91 
 
 
444 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  27.4 
 
 
569 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  31.18 
 
 
387 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  29.79 
 
 
697 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  29.14 
 
 
372 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  27.91 
 
 
655 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  31.51 
 
 
634 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  32.95 
 
 
322 aa  57.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  23.5 
 
 
570 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  32.85 
 
 
671 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  29.38 
 
 
662 aa  57.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  23.5 
 
 
570 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  24.75 
 
 
580 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  23.37 
 
 
570 aa  57.4  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  32.12 
 
 
698 aa  57.4  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  30 
 
 
1193 aa  57.4  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  32.35 
 
 
388 aa  57  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  31.76 
 
 
788 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  32.37 
 
 
445 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  31.25 
 
 
680 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1967  ATPase central domain-containing protein  27.47 
 
 
298 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  31.69 
 
 
1085 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04550  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 
1577 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.246201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  27.33 
 
 
239 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  28.04 
 
 
622 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17718  predicted protein  29.21 
 
 
1177 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  30.22 
 
 
689 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  28.18 
 
 
731 aa  55.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  33.58 
 
 
390 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  24.46 
 
 
570 aa  53.9  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  32.85 
 
 
687 aa  53.5  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  28.46 
 
 
228 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  29.21 
 
 
326 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>