More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0186 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  100 
 
 		 106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  100 
 
 		 106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  100 
 
 		 106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  100 
 
 		 106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  100 
 
 		 106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  100 
 
 		 106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  100 
 
 		 106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0282  ISMca2, transposase, OrfA  70.37 
 
 		 120 aa  146  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  70.37 
 
 		 110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  68.22 
 
 		 110 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  68.22 
 
 		 110 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  68.22 
 
 		 110 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  71.13 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  62.5 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  62.5 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  62.5 
 
 		 99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  62.5 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  62.5 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  62.5 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  62.5 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  62.5 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  62.5 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  62.5 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  61.46 
 
 		 98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  61.46 
 
 		 98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  64.04 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  64.04 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  64.04 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  64.04 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  64.04 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  64.04 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  64.04 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  61.96 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  61.96 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  58.7 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  58.7 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  58.7 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  58.7 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2525  transposase IS3/IS911 family protein  55.84 
 
 		 80 aa  90.9  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2764  transposase IS3/IS911 family protein  53.25 
 
 		 80 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0267308  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3877  transposase IS3/IS911 family protein  53.25 
 
 		 80 aa  84.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419535  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0579  ISRSO8-transposase orfA protein  57.3 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1550  ISRSO8-transposase orfA protein  57.3 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2268  ISRSO8-transposase orfA protein  57.3 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0547  ISRSO8-transposase orfA protein  57.3 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0674  putative transposase  48.31 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.635959 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  47.87 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4962  transposase IS3/IS911 family protein  56.18 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4891  transposase IS3/IS911 family protein  56.18 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  46.88 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  45.74 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  45.74 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  46.07 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  46.94 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  44.79 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  46.94 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  40.86 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  40.86 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  40.86 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  40.86 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  40.86 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  40.86 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  42.55 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  42.55 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  44.68 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4644  transposase family  43.62 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  45.92 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  45.92 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  45.92 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  37 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  41.49 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  41.67 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  41.67 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3643  transposase  52.38 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>