201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_AR0049 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_R0021  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0415147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0100  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0050  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0048  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0049  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.443386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0050  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0050  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293545  normal  0.0134461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0058  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0013  tRNA-Val  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.557667  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0016  tRNA-Val  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0267125  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0036  tRNA-Val  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429203  normal  0.313017 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0032  tRNA-Val  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0382858 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0033  tRNA-Val  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.166955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0042  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS02886  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.96324  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.752155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2476  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0032  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000419269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0044  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2123  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0039  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.654664  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0017  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1953  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3351  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0607256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2318  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0283125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2359  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1228  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0011  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0022  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1639  tRNA-Val  93.15 
 
 		 78 bp  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.42917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0506  tRNA-Val  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000210489  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0022  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0015  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0394069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0037  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104744  normal  0.385221 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0013  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.459697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0037  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599971  normal  0.116724 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0024  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.409216  normal  0.339151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0043  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000280883  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0036  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000106131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0051  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0408927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0020  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0249185  hitchhiker  0.00249648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0031  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000744729  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0027  tRNA-Val  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0023  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0014  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.20827  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna41  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0027  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0029  tRNA-Val  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000448285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0032  tRNA-Val  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.69442e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0027  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00584836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-1  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00200335  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  86.84 
 
 		 378 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt21  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  86.84 
 
 		 367 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt21  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0025  tRNA-Val  88.16 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0254254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0004  tRNA-Val  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000000388109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0048  tRNA-Val  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0045  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000428882  hitchhiker  0.00000000692947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0047  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0721509  normal  0.0848173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0049  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0385641  normal  0.0854931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0051  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114614  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0053  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113148  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0055  tRNA-Val  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100813  normal  0.0566569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00018  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000172255  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00041  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000120834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00042  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000123332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00043  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000135072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0032  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0034  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000138641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0057  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0879  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000126601  normal  0.645347 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2554  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R10  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2608  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000643017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2556  tRNA-Val  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000389314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0584  tRNA-Val  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.67929e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0038  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000627564  hitchhiker  0.00122334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0023  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0696683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0039  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000567069  hitchhiker  0.00359795 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0037  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000578787  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0070  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000583072  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0815  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000696983  normal  0.877811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2610  tRNA-Val  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000740519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2609  tRNA-Val  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000718351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0046  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000479411  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0048  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000458542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2555  tRNA-Val  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000393303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0072  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560906  normal  0.267671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0665  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000217876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5050  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2967  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.52961e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2966  tRNA-Val  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.55159e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2837  tRNA-Val  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.88964e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4656  tRNA-Val  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.90971e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4658  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.127679999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4681  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.95676e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4682  tRNA-Val  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.8092300000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4683  tRNA-Val  84.21 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.66609e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5021  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>