More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3809 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  100 
 
 
340 aa  668  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  73.27 
 
 
330 aa  471  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  72.16 
 
 
335 aa  461  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  71.39 
 
 
333 aa  458  1e-128  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  74.68 
 
 
332 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  68.17 
 
 
330 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  69.04 
 
 
333 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  69.11 
 
 
333 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  68.37 
 
 
333 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  68.37 
 
 
333 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  66.86 
 
 
339 aa  407  1e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  63.53 
 
 
327 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  62.61 
 
 
333 aa  399  1e-110  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  62.31 
 
 
327 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  61.73 
 
 
339 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  61.7 
 
 
327 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  63.06 
 
 
332 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.2508e-05  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  61.4 
 
 
327 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  61.7 
 
 
327 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  61.7 
 
 
327 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  61.7 
 
 
327 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  61.09 
 
 
327 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  60.49 
 
 
327 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  60.49 
 
 
327 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  61.92 
 
 
327 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  61.09 
 
 
327 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  60.79 
 
 
327 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  61.09 
 
 
327 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  60.49 
 
 
327 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  60.49 
 
 
327 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  60.49 
 
 
327 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  60.49 
 
 
327 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  60.18 
 
 
327 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  58.54 
 
 
333 aa  360  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  58.66 
 
 
327 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  60.99 
 
 
327 aa  357  2e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  54.01 
 
 
330 aa  356  3e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  54.22 
 
 
329 aa  355  6e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  58.04 
 
 
346 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  58.54 
 
 
335 aa  353  3e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  58.44 
 
 
324 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  57.27 
 
 
333 aa  350  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  56.92 
 
 
328 aa  349  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  56.92 
 
 
328 aa  349  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  56.92 
 
 
328 aa  349  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  56.92 
 
 
328 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  56.92 
 
 
328 aa  349  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  56.92 
 
 
328 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  56.92 
 
 
328 aa  349  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  56.92 
 
 
328 aa  349  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  56.6 
 
 
328 aa  348  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  58.24 
 
 
329 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  57.23 
 
 
328 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  57.23 
 
 
328 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  57.23 
 
 
328 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  54.01 
 
 
330 aa  346  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  57.23 
 
 
328 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  56.88 
 
 
328 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  56.33 
 
 
345 aa  344  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  56.33 
 
 
345 aa  344  1e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  59.33 
 
 
341 aa  343  3e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  54.13 
 
 
326 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  55.38 
 
 
326 aa  340  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  54.13 
 
 
324 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  57.37 
 
 
330 aa  340  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  54.79 
 
 
324 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  53.31 
 
 
344 aa  340  3e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  52.45 
 
 
323 aa  339  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  53.75 
 
 
325 aa  338  5e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  54.49 
 
 
324 aa  338  6e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  54.43 
 
 
325 aa  338  8e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  58.54 
 
 
328 aa  338  9e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  54.19 
 
 
324 aa  337  2e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  56.15 
 
 
326 aa  336  3e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.69 
 
 
357 aa  335  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.69 
 
 
342 aa  335  8e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.71 
 
 
328 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  53.29 
 
 
324 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  53.44 
 
 
325 aa  333  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  55.38 
 
 
325 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  54.77 
 
 
323 aa  332  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  52.35 
 
 
324 aa  332  7e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  51.94 
 
 
324 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  52.2 
 
 
324 aa  330  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  53.7 
 
 
330 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  52.1 
 
 
324 aa  329  5e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  49.24 
 
 
326 aa  328  6e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  53.8 
 
 
323 aa  328  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  51.8 
 
 
324 aa  328  1e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  52.19 
 
 
325 aa  327  2e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  52.19 
 
 
325 aa  326  4e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.77 
 
 
328 aa  325  9e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  52.19 
 
 
325 aa  324  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  53.63 
 
 
323 aa  323  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.77 
 
 
328 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  52.5 
 
 
325 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  52.83 
 
 
324 aa  321  1e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  50.94 
 
 
325 aa  321  1e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  50.94 
 
 
325 aa  321  1e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.62 
 
 
325 aa  321  1e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>