267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3801 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  100 
 
 		 502 aa  983    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  37.31 
 
 		 511 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  38.22 
 
 		 533 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  37.19 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  39.25 
 
 		 508 aa  250  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  34.12 
 
 		 539 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  31.87 
 
 		 540 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  33.83 
 
 		 535 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  32.83 
 
 		 539 aa  243  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  33.41 
 
 		 535 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  32.32 
 
 		 480 aa  243  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  34.6 
 
 		 519 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  31.94 
 
 		 538 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  31.47 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  34.23 
 
 		 507 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  32 
 
 		 527 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  30.8 
 
 		 549 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  32.81 
 
 		 533 aa  231  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  31.34 
 
 		 532 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  32.1 
 
 		 546 aa  227  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  33.79 
 
 		 517 aa  226  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  32.09 
 
 		 521 aa  206  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  31.15 
 
 		 670 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  31.8 
 
 		 669 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  31.26 
 
 		 693 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  31.14 
 
 		 688 aa  147  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 		 675 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  28.34 
 
 		 656 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  22.62 
 
 		 645 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  27.48 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  26.61 
 
 		 680 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  27.9 
 
 		 475 aa  106  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  30.83 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  26.35 
 
 		 668 aa  104  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  27.74 
 
 		 515 aa  99.4  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  34.11 
 
 		 545 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  24.67 
 
 		 521 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 503 aa  94.7  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  28.42 
 
 		 546 aa  93.6  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  26.43 
 
 		 499 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  28.28 
 
 		 612 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  24.88 
 
 		 480 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  25.52 
 
 		 518 aa  90.1  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  23.19 
 
 		 477 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  32.3 
 
 		 740 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  33.92 
 
 		 506 aa  89.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  33.66 
 
 		 527 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  28.22 
 
 		 525 aa  88.2  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  33 
 
 		 505 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  27.01 
 
 		 499 aa  87.4  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  26.03 
 
 		 511 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  26.03 
 
 		 511 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  26.03 
 
 		 511 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  29.02 
 
 		 571 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  32.89 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1192  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  26.56 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  24.77 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  33.33 
 
 		 532 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  27.81 
 
 		 564 aa  83.6  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  25.11 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  32.17 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  26.13 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  31.2 
 
 		 538 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  27.63 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  29.27 
 
 		 521 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  24.38 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  25.7 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  25 
 
 		 525 aa  80.5  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  28.39 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  25 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  28.67 
 
 		 495 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  25.17 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  32.99 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  28.41 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  30.16 
 
 		 542 aa  77  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  29.2 
 
 		 544 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  27.31 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  28.03 
 
 		 643 aa  76.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  30.41 
 
 		 506 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  27.27 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  26.94 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  26.27 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  29.44 
 
 		 597 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  26.45 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  25.9 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  32.46 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  25.72 
 
 		 542 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  26.54 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  29.43 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  31.09 
 
 		 505 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  27.36 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  31.51 
 
 		 522 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  27.46 
 
 		 535 aa  72.8  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  31.51 
 
 		 530 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  31.28 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  31.28 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  31.28 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>