211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3791 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  66.56 
 
 
624 aa  823    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  68.65 
 
 
618 aa  822    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  56.64 
 
 
599 aa  665    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  53.19 
 
 
598 aa  639    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  67.79 
 
 
620 aa  831    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  66.61 
 
 
606 aa  812    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  64.08 
 
 
593 aa  789    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  55.31 
 
 
589 aa  661    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  56.29 
 
 
593 aa  638    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  67.9 
 
 
657 aa  821    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  69.14 
 
 
606 aa  841    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  66.28 
 
 
606 aa  807    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  100 
 
 
598 aa  1211    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  67.34 
 
 
640 aa  823    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  61.46 
 
 
603 aa  744    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  54.5 
 
 
592 aa  632  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  52.62 
 
 
596 aa  631  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  52.97 
 
 
595 aa  625  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  52.94 
 
 
598 aa  626  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  52.86 
 
 
598 aa  624  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  52.28 
 
 
595 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  51.77 
 
 
594 aa  602  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  47.8 
 
 
597 aa  532  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  47.46 
 
 
597 aa  528  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  39.87 
 
 
593 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  37.06 
 
 
594 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  38.58 
 
 
593 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  36.81 
 
 
602 aa  319  9e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  36.76 
 
 
597 aa  310  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  35.34 
 
 
613 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  36 
 
 
599 aa  306  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  35.24 
 
 
611 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  34.68 
 
 
613 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  35.28 
 
 
625 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  34.79 
 
 
594 aa  301  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  35.29 
 
 
594 aa  299  8e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  36.45 
 
 
602 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  36.01 
 
 
602 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  36.15 
 
 
619 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  35.09 
 
 
623 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  34.92 
 
 
623 aa  296  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  37.23 
 
 
609 aa  296  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  36.11 
 
 
600 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  34.4 
 
 
599 aa  292  9e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  36.59 
 
 
609 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  36.06 
 
 
596 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  36.59 
 
 
609 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  34 
 
 
594 aa  292  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  35.84 
 
 
605 aa  291  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  35.76 
 
 
593 aa  291  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  36.01 
 
 
609 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  35.33 
 
 
605 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  33.6 
 
 
612 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  35.05 
 
 
599 aa  290  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  36.42 
 
 
609 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  36.06 
 
 
611 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  34.48 
 
 
617 aa  290  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  36.42 
 
 
609 aa  290  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  35 
 
 
627 aa  290  8e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  35.75 
 
 
612 aa  289  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  35.85 
 
 
611 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  35.01 
 
 
605 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  34.33 
 
 
596 aa  286  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  35.4 
 
 
600 aa  286  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  34.61 
 
 
602 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  35.23 
 
 
586 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  35.52 
 
 
601 aa  283  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  35.77 
 
 
616 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 
619 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  34.08 
 
 
629 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  34.65 
 
 
608 aa  281  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  33.77 
 
 
610 aa  280  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  35.31 
 
 
596 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  34.04 
 
 
628 aa  278  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  33.5 
 
 
595 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  34.1 
 
 
601 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  31.22 
 
 
894 aa  277  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  35.82 
 
 
613 aa  277  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  34.47 
 
 
624 aa  277  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  32.72 
 
 
609 aa  276  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  34.95 
 
 
602 aa  276  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  34.42 
 
 
614 aa  276  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  34.21 
 
 
850 aa  276  9e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  33.84 
 
 
602 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  34.39 
 
 
600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  33.99 
 
 
629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  35.82 
 
 
610 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  33.84 
 
 
608 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 
610 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  32.85 
 
 
635 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  35.82 
 
 
610 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  35.82 
 
 
610 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  35.82 
 
 
610 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  35.82 
 
 
610 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  35.82 
 
 
610 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  35.96 
 
 
665 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  29.67 
 
 
606 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  33.77 
 
 
645 aa  273  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  34.49 
 
 
596 aa  273  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  32.14 
 
 
627 aa  273  9e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>