More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3650 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  100 
 
 		 286 aa  560  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  72.16 
 
 		 276 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  72.16 
 
 		 276 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  72.16 
 
 		 276 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  71.43 
 
 		 276 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  67.65 
 
 		 278 aa  363  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  62.36 
 
 		 278 aa  338  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  61.25 
 
 		 275 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  64.47 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  64.84 
 
 		 274 aa  319  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  65.33 
 
 		 286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  64.71 
 
 		 278 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  61.62 
 
 		 275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  63.1 
 
 		 279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  65.09 
 
 		 286 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  64.73 
 
 		 286 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  60.9 
 
 		 276 aa  295  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  64.73 
 
 		 286 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  60.08 
 
 		 278 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  58.3 
 
 		 274 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  66.05 
 
 		 286 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  64.73 
 
 		 286 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  65.68 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  50.92 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  57.14 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  56.06 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  52.63 
 
 		 280 aa  248  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  49.45 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  55.51 
 
 		 281 aa  242  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  57.59 
 
 		 276 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  52.94 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  47.79 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  55.56 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  50.37 
 
 		 275 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  49.64 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  55.56 
 
 		 274 aa  231  9e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  48.29 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  50.58 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  44.73 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  54.81 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  49.63 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  46.97 
 
 		 272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  55.85 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  46.21 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  46.39 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  47.35 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  48.87 
 
 		 276 aa  205  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  42.8 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  39.13 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  41.32 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  31.27 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  39.13 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  30.32 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.55 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  29.1 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  29.1 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  37.96 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.58 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  34.96 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  40.91 
 
 		 425 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  28.09 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  35.68 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  33.58 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  33.7 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  36.56 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  30.74 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  35.91 
 
 		 258 aa  99  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  34.87 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  37.79 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  35.32 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  37.66 
 
 		 253 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  35 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  31.85 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  36.23 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  30.82 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  36.36 
 
 		 255 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  34.58 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  38.82 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  34.92 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  32.35 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  33.92 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  29.37 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  38.86 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  35.71 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  33.62 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  38.53 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  31.62 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  34.63 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  36.08 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  36.08 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  36.08 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  29.21 
 
 		 284 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  35.45 
 
 		 258 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  29.21 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  29.37 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  29.21 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  34.07 
 
 		 258 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  29.21 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  29.02 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0659  2,3-dimethylmalate lyase  29.66 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>