More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3621 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3621  response regulatory protein  100 
 
 		 243 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0192509  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  33.61 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 259 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  33.47 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.05 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  31.38 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.78 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.19 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.52 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  31.22 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 209 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  31.22 
 
 		 215 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 213 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  30.08 
 
 		 220 aa  99.4  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 219 aa  99.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  32.2 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.96 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  34.18 
 
 		 221 aa  99  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 215 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.2 
 
 		 216 aa  98.6  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.38 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  31.22 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1544  two component LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  31.22 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  31.22 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  31.22 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.38 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.96 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  31.22 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  31.22 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  32.46 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1418  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.39 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.45 
 
 		 215 aa  95.9  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  31.06 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.66 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  30.86 
 
 		 218 aa  95.1  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.91 
 
 		 220 aa  95.1  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 222 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 216 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  32.13 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.74 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1053  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.0294181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.83 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.49 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  30.57 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.89 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  32.63 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.71 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2840  LuxR family two component transcriptional regulator  32.07 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.29 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 292 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.3 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.71 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.47 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.2 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.96 
 
 		 219 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.16 
 
 		 218 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.48 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1923  two component LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.177648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.54 
 
 		 234 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  31.36 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.54 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 250 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.83 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.42 
 
 		 211 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1558  two component LuxR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  32.64 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  31.09 
 
 		 213 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>