More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3539 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  100 
 
 		 761 aa  1568    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  34.73 
 
 		 475 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  32.46 
 
 		 471 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  33.19 
 
 		 478 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  32.24 
 
 		 478 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  33.19 
 
 		 478 aa  225  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  32.46 
 
 		 478 aa  224  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  32.24 
 
 		 471 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  32.55 
 
 		 478 aa  223  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  31.6 
 
 		 478 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  30.95 
 
 		 468 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.18 
 
 		 490 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  29.8 
 
 		 481 aa  199  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  30.32 
 
 		 495 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1591  twin-arginine translocation pathway signal  30.13 
 
 		 497 aa  183  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  28.75 
 
 		 481 aa  177  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 		 484 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  28.5 
 
 		 441 aa  93.6  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  23.74 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  25.61 
 
 		 433 aa  76.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  32.32 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  26.79 
 
 		 457 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  26.79 
 
 		 457 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  28.92 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.78 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  27.42 
 
 		 444 aa  73.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  27.07 
 
 		 427 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.12 
 
 		 433 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  27.37 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  30.11 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.28 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  21.6 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  28.74 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  20.18 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  24.94 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.45 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  27.84 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  30.21 
 
 		 560 aa  67.4  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  32.43 
 
 		 436 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  33.06 
 
 		 473 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  30.51 
 
 		 464 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  34.06 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.81 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  27.81 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  26.58 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.81 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  33.1 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  34.82 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.7 
 
 		 433 aa  63.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.61 
 
 		 472 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.82 
 
 		 456 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.78 
 
 		 444 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.86 
 
 		 447 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  24.66 
 
 		 425 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  27.94 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.35 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.74 
 
 		 445 aa  63.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  27.04 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  26.29 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.28 
 
 		 906 aa  62.4  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  28.4 
 
 		 764 aa  62  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.68 
 
 		 437 aa  62  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  31.78 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  24.68 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  28 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  32.75 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.78 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  25.1 
 
 		 752 aa  60.8  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03351  conserved hypothetical protein  31.29 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.73 
 
 		 467 aa  60.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.6 
 
 		 445 aa  60.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.07 
 
 		 1038 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  28 
 
 		 462 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.21 
 
 		 1007 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  31.61 
 
 		 985 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  30.63 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1788  FAD linked oxidase domain protein  28.25 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  23.02 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  30.34 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 		 463 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  25.15 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.89 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  28.42 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  30.12 
 
 		 973 aa  58.5  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 754 aa  58.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  28.06 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.49 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  28.25 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.72 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  27.61 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  25.19 
 
 		 753 aa  57.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  28.65 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25 
 
 		 734 aa  57.4  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.08 
 
 		 1005 aa  57.4  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  28.21 
 
 		 413 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  27.59 
 
 		 574 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0898  FAD linked oxidase-like  28.16 
 
 		 485 aa  57.4  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52647  mitochondrial lactate ferricytochrome c oxidoreductase  28.12 
 
 		 489 aa  57  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>